53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0238 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0238  carbonic anhydrase  100 
 
 
213 aa  445  1.0000000000000001e-124  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4960  carbonate dehydratase  42.65 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3200  carbonate dehydratase  42.65 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4235  carbonate dehydratase  38.86 
 
 
259 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355304  normal  0.29806 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1056  carbonic anhydrase precursor  38.42 
 
 
235 aa  143  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0030  carbonate dehydratase  37.06 
 
 
249 aa  141  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123729  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0785  carbonate dehydratase  36.02 
 
 
252 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2952  carbonic anhydrase  39 
 
 
258 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3166  Carbonate dehydratase  39 
 
 
258 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0412  carbonate dehydratase  37.06 
 
 
245 aa  135  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.289569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0512  carbonate dehydratase  38.14 
 
 
370 aa  135  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0845304 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2228  carbonate dehydratase  35.57 
 
 
249 aa  134  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103862  normal  0.0736818 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1236  carbonate dehydratase  34.83 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4422  carbonate dehydratase  36.63 
 
 
244 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000131001  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0791  carbonic anhydrase (carbonate dehydratase)  33.81 
 
 
253 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00959218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0359  carbonate dehydratase  32.7 
 
 
261 aa  131  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3922  carbonic anhydrase  33.01 
 
 
481 aa  131  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4625  carbonate dehydratase  34.12 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3753  carbonate dehydratase  35.03 
 
 
247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.405965 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05086  carbonic anhydrase  36.22 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2167  carbonic anhydrase  33.33 
 
 
258 aa  128  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0204044 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2073  carbonic anhydrase  36.89 
 
 
207 aa  126  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.495704  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000779  carbonic anhydrase  36.04 
 
 
239 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3698  carbonate dehydratase  35.47 
 
 
246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0973  twin-arginine translocation pathway signal  32.84 
 
 
264 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0132613  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001220  carbonic anhydrase  36.22 
 
 
239 aa  125  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3462  carbonic anhydrase  32.37 
 
 
614 aa  122  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0862  Carbonate dehydratase  32.51 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2660  carbonate dehydratase  31.6 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0379533  normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2853  Carbonate dehydratase  32.54 
 
 
256 aa  118  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0242  carbonic anhydrase  33.82 
 
 
244 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1623  carbonate dehydratase  33.17 
 
 
260 aa  115  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.108913  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0758  carbonate dehydratase  32.38 
 
 
250 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.415587  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0578  Carbonate dehydratase  37.24 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218816  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0238  Carbonate dehydratase  32.84 
 
 
244 aa  112  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0957  carbonic anhydrase  34.83 
 
 
239 aa  112  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000379553  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2989  carbonic anhydrase  32.09 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.0164403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1725  carbonate dehydratase  34.67 
 
 
259 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1545  carbonate dehydratase  31 
 
 
315 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6140  carbonate dehydratase  32.32 
 
 
249 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1480  carbonate dehydratase  34.66 
 
 
243 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.551291  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0465  carbonate dehydratase  36 
 
 
288 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1132  carbonate dehydratase  30.94 
 
 
315 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0536643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  30.95 
 
 
440 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  29.33 
 
 
436 aa  91.3  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  29.33 
 
 
436 aa  91.3  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0461  carbonate dehydratase  34.67 
 
 
313 aa  87.8  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.454779  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1388  carbonate dehydratase  38.35 
 
 
237 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301506  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1080  carbonic anhydrase  32.19 
 
 
264 aa  85.1  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.759573  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1514  conserved hypothetical protein, putative carbonic anhydrase  25 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2138  carbonic anhydrase  28.08 
 
 
191 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00878397  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_55029  predicted protein  24.16 
 
 
324 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35370  predicted protein  22.33 
 
 
487 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>