50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1514 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1514  conserved hypothetical protein, putative carbonic anhydrase  100 
 
 
246 aa  500  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0030  carbonate dehydratase  31.4 
 
 
249 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123729  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1236  carbonate dehydratase  34.45 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001220  carbonic anhydrase  35.38 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0242  carbonic anhydrase  34.43 
 
 
244 aa  125  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4422  carbonate dehydratase  31.75 
 
 
244 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000131001  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05086  carbonic anhydrase  33.85 
 
 
241 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0862  Carbonate dehydratase  32.47 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0957  carbonic anhydrase  32.82 
 
 
239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000379553  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000779  carbonic anhydrase  31.62 
 
 
239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3753  carbonate dehydratase  30.83 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.405965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0791  carbonic anhydrase (carbonate dehydratase)  32.66 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00959218 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3166  Carbonate dehydratase  28.19 
 
 
258 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2952  carbonic anhydrase  28.19 
 
 
258 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0238  Carbonate dehydratase  32.55 
 
 
244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0785  carbonate dehydratase  30.85 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4625  carbonate dehydratase  30.93 
 
 
263 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3698  carbonate dehydratase  31.6 
 
 
246 aa  111  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0578  Carbonate dehydratase  31.3 
 
 
246 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218816  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1056  carbonic anhydrase precursor  34.36 
 
 
235 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2167  carbonic anhydrase  29.11 
 
 
258 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0204044 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0412  carbonate dehydratase  30.77 
 
 
245 aa  106  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.289569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1480  carbonate dehydratase  31.25 
 
 
243 aa  105  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.551291  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0758  carbonate dehydratase  32.49 
 
 
250 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.415587  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1132  carbonate dehydratase  29.03 
 
 
315 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0536643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2660  carbonate dehydratase  29.2 
 
 
255 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0379533  normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2989  carbonic anhydrase  31.66 
 
 
267 aa  101  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.0164403 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2853  Carbonate dehydratase  32.39 
 
 
256 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3922  carbonic anhydrase  30.88 
 
 
481 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2228  carbonate dehydratase  23.72 
 
 
249 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103862  normal  0.0736818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0512  carbonate dehydratase  26.56 
 
 
370 aa  99.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0845304 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1623  carbonate dehydratase  30.92 
 
 
260 aa  99  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.108913  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0973  twin-arginine translocation pathway signal  27.31 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0132613  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1545  carbonate dehydratase  29.85 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0359  carbonate dehydratase  25.79 
 
 
261 aa  95.9  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6140  carbonate dehydratase  26.52 
 
 
249 aa  89.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1725  carbonate dehydratase  28.76 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0465  carbonate dehydratase  26.82 
 
 
288 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4235  carbonate dehydratase  26.92 
 
 
259 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355304  normal  0.29806 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4960  carbonate dehydratase  25.6 
 
 
259 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3200  carbonate dehydratase  25.6 
 
 
259 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0461  carbonate dehydratase  28.43 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.454779  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3462  carbonic anhydrase  23.56 
 
 
614 aa  79.3  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1388  carbonate dehydratase  25 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301506  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  24.32 
 
 
436 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  24.32 
 
 
436 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0238  carbonic anhydrase  25 
 
 
213 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  23.53 
 
 
440 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1080  carbonic anhydrase  25.49 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.759573  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2073  carbonic anhydrase  27.54 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.495704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>