53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0238 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0238  Carbonate dehydratase  100 
 
 		 244 aa  504  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0242  carbonic anhydrase  89.75 
 
 		 244 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4422  carbonate dehydratase  70.78 
 
 		 244 aa  364  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000131001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3698  carbonate dehydratase  49.55 
 
 		 246 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001220  carbonic anhydrase  51.34 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1480  carbonate dehydratase  44.86 
 
 		 243 aa  232  5e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.551291  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05086  carbonic anhydrase  45.68 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1623  carbonate dehydratase  43.44 
 
 		 260 aa  221  6e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.108913  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1236  carbonate dehydratase  43.32 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000779  carbonic anhydrase  48.9 
 
 		 239 aa  215  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0957  carbonic anhydrase  45.99 
 
 		 239 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000379553  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0862  Carbonate dehydratase  45.91 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0030  carbonate dehydratase  42.92 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123729  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0512  carbonate dehydratase  42.01 
 
 		 370 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0845304 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3922  carbonic anhydrase  41.53 
 
 		 481 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4625  carbonate dehydratase  43.64 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1056  carbonic anhydrase precursor  41.42 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0412  carbonate dehydratase  40.5 
 
 		 245 aa  192  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.289569  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1545  carbonate dehydratase  40.89 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0578  Carbonate dehydratase  40.33 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218816  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0973  twin-arginine translocation pathway signal  40.83 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0132613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0785  carbonate dehydratase  41.63 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3753  carbonate dehydratase  37.45 
 
 		 247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.405965 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2167  carbonic anhydrase  42.79 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0204044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1725  carbonate dehydratase  42.24 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0758  carbonate dehydratase  41.59 
 
 		 250 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.415587  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2952  carbonic anhydrase  36.51 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3166  Carbonate dehydratase  36.51 
 
 		 258 aa  178  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0791  carbonic anhydrase (carbonate dehydratase)  38.91 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00959218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2228  carbonate dehydratase  36.51 
 
 		 249 aa  175  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103862  normal  0.0736818 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6140  carbonate dehydratase  41.89 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2660  carbonate dehydratase  38.33 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0379533  normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1132  carbonate dehydratase  39.57 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0536643  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0359  carbonate dehydratase  40.2 
 
 		 261 aa  165  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2853  Carbonate dehydratase  36.65 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2989  carbonic anhydrase  39.71 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.0164403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3462  carbonic anhydrase  30.63 
 
 		 614 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4960  carbonate dehydratase  36.23 
 
 		 259 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0461  carbonate dehydratase  36.29 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.454779  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3200  carbonate dehydratase  36.23 
 
 		 259 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0465  carbonate dehydratase  36.67 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  36.21 
 
 		 440 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4235  carbonate dehydratase  36.89 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355304  normal  0.29806 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1388  carbonate dehydratase  32.33 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  33.76 
 
 		 436 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  33.76 
 
 		 436 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1514  conserved hypothetical protein, putative carbonic anhydrase  32.55 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1080  carbonic anhydrase  31.91 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.759573  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0238  carbonic anhydrase  32.84 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2073  carbonic anhydrase  30.48 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.495704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2138  carbonic anhydrase  25.74 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00878397  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35370  predicted protein  33.33 
 
 		 487 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_55029  predicted protein  24.49 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>