50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2328 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2328  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2324  hypothetical protein  42.24 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1067  hypothetical protein  43.53 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2327  hypothetical protein  49.18 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2338  hypothetical protein  35.8 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1090  hypothetical protein  60 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2427  hypothetical protein  77.42 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0532981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2339  hypothetical protein  78.79 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2325  hypothetical protein  88 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2326  hypothetical protein  45.16 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1593  hypothetical protein  70 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157492 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  54.55 
 
 		 497 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0167  hypothetical protein  67.65 
 
 		 239 aa  52.4  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1800  hypothetical protein  38.46 
 
 		 209 aa  52  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2728  phosphatase-like  46.94 
 
 		 462 aa  52.4  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.427102  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1718  hypothetical protein  75 
 
 		 226 aa  51.6  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000144169  unclonable  0.000000229382 
 
 
 
NC_007404  Tbd_1803  hypothetical protein  92 
 
 		 266 aa  51.2  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2005  hypothetical protein  42.47 
 
 		 148 aa  51.6  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00997836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2031  hypothetical protein  61.29 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1249  hypothetical protein  72.41 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1594  hypothetical protein  31.75 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3745  hypothetical protein  32.08 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0849557  normal  0.712692 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0506  hypothetical protein  27.78 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40604  normal  0.281124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1091  hypothetical protein  39.08 
 
 		 229 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0352  hypothetical protein  71.43 
 
 		 285 aa  48.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.972359  normal  0.0160007 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1713  hypothetical protein  65.52 
 
 		 270 aa  48.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  36.76 
 
 		 433 aa  47.8  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  63.33 
 
 		 326 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2096  hypothetical protein  38.89 
 
 		 259 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0004226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0709  hypothetical protein  60.61 
 
 		 261 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0471  hypothetical protein  53.66 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.562548  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  79.17 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0262  hypothetical protein  60 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000101412  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2731  hypothetical protein  58.82 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000468219  unclonable  0.000000144909 
 
 
 
NC_007947  Mfla_1203  hypothetical protein  47.37 
 
 		 242 aa  45.1  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.743996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  58.62 
 
 		 288 aa  45.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1259  hypothetical protein  56.25 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2253  hypothetical protein  55.88 
 
 		 248 aa  44.7  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000307297  unclonable  0.000000143416 
 
 
 
NC_007947  Mfla_0088  hypothetical protein  54.84 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1122  hypothetical protein  47.27 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.182832 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2195  hypothetical protein  56.25 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0465  carbonate dehydratase  72 
 
 		 288 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2252  hypothetical protein  56.67 
 
 		 233 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1190  hypothetical protein  75 
 
 		 268 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100853  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1804  hypothetical protein  75 
 
 		 227 aa  42  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.206043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1261  hypothetical protein  59.26 
 
 		 269 aa  41.6  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1132  hypothetical protein  62.96 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566375  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  41.82 
 
 		 419 aa  41.6  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2396  hypothetical protein  50 
 
 		 166 aa  41.2  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000890188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2578  hypothetical protein  53.33 
 
 		 294 aa  41.2  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>