53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3922 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3922  carbonic anhydrase  100 
 
 
481 aa  990    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0512  carbonate dehydratase  60.18 
 
 
370 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0845304 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3462  carbonic anhydrase  41.51 
 
 
614 aa  249  6e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0030  carbonate dehydratase  45.33 
 
 
249 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3753  carbonate dehydratase  47.98 
 
 
247 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.405965 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4625  carbonate dehydratase  45.38 
 
 
263 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2167  carbonic anhydrase  46.82 
 
 
258 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0204044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0862  Carbonate dehydratase  43.44 
 
 
252 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0791  carbonic anhydrase (carbonate dehydratase)  44.39 
 
 
253 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00959218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3698  carbonate dehydratase  44.2 
 
 
246 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0785  carbonate dehydratase  45.05 
 
 
252 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0412  carbonate dehydratase  44.39 
 
 
245 aa  202  9e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.289569  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0242  carbonic anhydrase  41.1 
 
 
244 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0973  twin-arginine translocation pathway signal  41.85 
 
 
264 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0132613  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1236  carbonate dehydratase  42.37 
 
 
252 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0238  Carbonate dehydratase  41.53 
 
 
244 aa  200  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4422  carbonate dehydratase  41.89 
 
 
244 aa  196  9e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000131001  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2660  carbonate dehydratase  43.44 
 
 
255 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0379533  normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0957  carbonic anhydrase  42.2 
 
 
239 aa  194  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000379553  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0758  carbonate dehydratase  44.69 
 
 
250 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.415587  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1725  carbonate dehydratase  44.39 
 
 
259 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1056  carbonic anhydrase precursor  43.52 
 
 
235 aa  188  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05086  carbonic anhydrase  38.46 
 
 
241 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2228  carbonate dehydratase  40.79 
 
 
249 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103862  normal  0.0736818 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3166  Carbonate dehydratase  40.37 
 
 
258 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2952  carbonic anhydrase  40.37 
 
 
258 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1480  carbonate dehydratase  40.81 
 
 
243 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.551291  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0359  carbonate dehydratase  42.47 
 
 
261 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1545  carbonate dehydratase  39.64 
 
 
315 aa  180  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001220  carbonic anhydrase  39.91 
 
 
239 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2853  Carbonate dehydratase  40 
 
 
256 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6140  carbonate dehydratase  41.36 
 
 
249 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1132  carbonate dehydratase  37.9 
 
 
315 aa  171  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0536643  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000779  carbonic anhydrase  38.5 
 
 
239 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1623  carbonate dehydratase  35.81 
 
 
260 aa  167  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.108913  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0578  Carbonate dehydratase  35.15 
 
 
246 aa  157  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218816  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2989  carbonic anhydrase  38.42 
 
 
267 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.0164403 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1080  carbonic anhydrase  35.69 
 
 
264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.759573  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1388  carbonate dehydratase  37.5 
 
 
237 aa  136  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301506  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  32.6 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  32.6 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0238  carbonic anhydrase  33.01 
 
 
213 aa  131  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4235  carbonate dehydratase  36.68 
 
 
259 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355304  normal  0.29806 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4960  carbonate dehydratase  35.18 
 
 
259 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3200  carbonate dehydratase  35.18 
 
 
259 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0465  carbonate dehydratase  36.27 
 
 
288 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  30.43 
 
 
440 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0461  carbonate dehydratase  35.65 
 
 
313 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.454779  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1514  conserved hypothetical protein, putative carbonic anhydrase  30.88 
 
 
246 aa  101  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2073  carbonic anhydrase  33.56 
 
 
207 aa  85.1  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.495704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2138  carbonic anhydrase  29.95 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00878397  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_55029  predicted protein  28.27 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35370  predicted protein  36.84 
 
 
487 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>