53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1388 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1388  carbonate dehydratase  100 
 
 		 237 aa  482  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1545  carbonate dehydratase  37.96 
 
 		 315 aa  161  7e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4625  carbonate dehydratase  36.78 
 
 		 263 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2660  carbonate dehydratase  40.27 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0379533  normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0785  carbonate dehydratase  35.95 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0862  Carbonate dehydratase  36.1 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2228  carbonate dehydratase  37.5 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103862  normal  0.0736818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0973  twin-arginine translocation pathway signal  37.05 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0132613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3753  carbonate dehydratase  33.06 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.405965 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1236  carbonate dehydratase  33.78 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0791  carbonic anhydrase (carbonate dehydratase)  38.03 
 
 		 253 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00959218 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0578  Carbonate dehydratase  34.48 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218816  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0412  carbonate dehydratase  33.63 
 
 		 245 aa  145  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.289569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0758  carbonate dehydratase  39.34 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.415587  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4422  carbonate dehydratase  34.22 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000131001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05086  carbonic anhydrase  34.44 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001220  carbonic anhydrase  34.45 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3922  carbonic anhydrase  37.5 
 
 		 481 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1480  carbonate dehydratase  37.23 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.551291  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0030  carbonate dehydratase  33.74 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123729  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2952  carbonic anhydrase  34.13 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1623  carbonate dehydratase  31.8 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.108913  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0957  carbonic anhydrase  37.21 
 
 		 239 aa  138  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000379553  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3166  Carbonate dehydratase  34.13 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000779  carbonic anhydrase  33.64 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1056  carbonic anhydrase precursor  35.43 
 
 		 235 aa  135  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2167  carbonic anhydrase  35.94 
 
 		 258 aa  134  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0204044 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6140  carbonate dehydratase  34.62 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0238  Carbonate dehydratase  32.76 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0512  carbonate dehydratase  37.26 
 
 		 370 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0845304 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3698  carbonate dehydratase  35.59 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0242  carbonic anhydrase  31.05 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2853  Carbonate dehydratase  35.65 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1725  carbonate dehydratase  33.49 
 
 		 259 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0359  carbonate dehydratase  33.86 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1080  carbonic anhydrase  32.69 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.759573  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3462  carbonic anhydrase  31.31 
 
 		 614 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2989  carbonic anhydrase  32.65 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.0164403 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1132  carbonate dehydratase  29.91 
 
 		 315 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0536643  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0238  carbonic anhydrase  38.35 
 
 		 213 aa  99  6e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  30.53 
 
 		 440 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4960  carbonate dehydratase  32.16 
 
 		 259 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3200  carbonate dehydratase  32.16 
 
 		 259 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  31.09 
 
 		 436 aa  91.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  31.09 
 
 		 436 aa  91.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0465  carbonate dehydratase  36.84 
 
 		 288 aa  89.4  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1514  conserved hypothetical protein, putative carbonic anhydrase  23.5 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0461  carbonate dehydratase  34.9 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.454779  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4235  carbonate dehydratase  33.77 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355304  normal  0.29806 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2073  carbonic anhydrase  32.84 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.495704  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_55029  predicted protein  25.21 
 
 		 324 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2138  carbonic anhydrase  32.14 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00878397  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35370  predicted protein  44.19 
 
 		 487 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>