38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1800 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1800  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2427  hypothetical protein  46.15 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0532981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0506  hypothetical protein  78.57 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40604  normal  0.281124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2252  hypothetical protein  38.05 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2328  hypothetical protein  38.46 
 
 		 181 aa  52  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1605  hypothetical protein  41.67 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1803  hypothetical protein  49.09 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0352  hypothetical protein  81.48 
 
 		 285 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.972359  normal  0.0160007 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2338  hypothetical protein  46.15 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  71.43 
 
 		 497 aa  48.9  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2325  hypothetical protein  47.46 
 
 		 150 aa  48.9  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1603  hypothetical protein  32.14 
 
 		 263 aa  48.9  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201894  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1713  hypothetical protein  62.07 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0088  hypothetical protein  66.67 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2031  hypothetical protein  42.65 
 
 		 179 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  57.58 
 
 		 326 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2728  phosphatase-like  55.88 
 
 		 462 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.427102  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1067  hypothetical protein  62.07 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0167  hypothetical protein  60 
 
 		 239 aa  45.4  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1718  hypothetical protein  67.86 
 
 		 226 aa  45.1  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000144169  unclonable  0.000000229382 
 
 
 
NC_010524  Lcho_1593  hypothetical protein  42.86 
 
 		 188 aa  45.1  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157492 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1804  hypothetical protein  73.08 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.206043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0709  hypothetical protein  60.71 
 
 		 261 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1090  hypothetical protein  62.96 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2096  hypothetical protein  58.62 
 
 		 259 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0004226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1122  hypothetical protein  64.29 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.182832 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2578  hypothetical protein  53.85 
 
 		 294 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0262  hypothetical protein  40.91 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000101412  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0505  hypothetical protein  86.36 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.269231 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1249  hypothetical protein  36.92 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2339  hypothetical protein  62.96 
 
 		 297 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1598  hypothetical protein  57.58 
 
 		 263 aa  42.4  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000163018  unclonable  0.000000204973 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  45.24 
 
 		 260 aa  42.4  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  60.61 
 
 		 288 aa  42.4  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1132  hypothetical protein  66.67 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566375  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2253  hypothetical protein  62.96 
 
 		 248 aa  41.6  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000307297  unclonable  0.000000143416 
 
 
 
NC_007947  Mfla_2195  hypothetical protein  51.43 
 
 		 199 aa  41.6  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2731  hypothetical protein  57.14 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000468219  unclonable  0.000000144909 
 
 
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>