46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2324 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2324  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  397  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3641  protein of unknown function DUF1555  37.38 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2328  hypothetical protein  42.24 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1940  hypothetical protein  39.1 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1800  protein of unknown function DUF1555  29.77 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1090  hypothetical protein  70.73 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1593  hypothetical protein  80 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2325  hypothetical protein  69.44 
 
 		 150 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1594  hypothetical protein  71.88 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2326  hypothetical protein  48.39 
 
 		 139 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1091  hypothetical protein  75 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1067  hypothetical protein  73.33 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2327  hypothetical protein  40.74 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2338  hypothetical protein  37.89 
 
 		 160 aa  52  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1249  hypothetical protein  75 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2427  hypothetical protein  62.5 
 
 		 231 aa  51.6  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0532981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2031  hypothetical protein  70 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2339  hypothetical protein  74.07 
 
 		 297 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0167  hypothetical protein  69.7 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1718  hypothetical protein  34.65 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000144169  unclonable  0.000000229382 
 
 
 
NC_007947  Mfla_2005  hypothetical protein  39.02 
 
 		 148 aa  48.5  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00997836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2728  phosphatase-like  61.29 
 
 		 462 aa  48.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.427102  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0709  hypothetical protein  64.71 
 
 		 261 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1713  hypothetical protein  67.74 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  48 
 
 		 497 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1803  hypothetical protein  80 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0352  hypothetical protein  66.67 
 
 		 285 aa  46.2  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.972359  normal  0.0160007 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0506  hypothetical protein  68.97 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40604  normal  0.281124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1203  hypothetical protein  67.86 
 
 		 242 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.743996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  57.58 
 
 		 326 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2731  hypothetical protein  63.64 
 
 		 217 aa  44.7  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000468219  unclonable  0.000000144909 
 
 
 
NC_007614  Nmul_A0262  hypothetical protein  54.76 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000101412  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1674  hypothetical protein  48.78 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.101851  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1502  hypothetical protein  30.89 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1190  hypothetical protein  79.17 
 
 		 268 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100853  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1259  hypothetical protein  63.33 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1390  hypothetical protein  48 
 
 		 379 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000676729  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2041  response regulator receiver domain-containing protein  30.56 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1122  hypothetical protein  68.97 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.182832 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2096  hypothetical protein  58.62 
 
 		 259 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0004226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  47.62 
 
 		 288 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  43.9 
 
 		 433 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0465  carbonate dehydratase  72 
 
 		 288 aa  42  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2195  hypothetical protein  59.38 
 
 		 199 aa  42  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0471  hypothetical protein  47.17 
 
 		 241 aa  41.6  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.562548  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  64 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>