27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1091 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1091  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1122  hypothetical protein  40.45 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.182832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2324  hypothetical protein  75 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1593  hypothetical protein  70.59 
 
 		 188 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1067  hypothetical protein  55.56 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2327  hypothetical protein  35.83 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2328  hypothetical protein  39.08 
 
 		 181 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1123  hypothetical protein  35.63 
 
 		 242 aa  48.5  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2338  hypothetical protein  42.86 
 
 		 160 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2326  hypothetical protein  63.33 
 
 		 139 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1718  hypothetical protein  44.44 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000144169  unclonable  0.000000229382 
 
 
 
NC_010524  Lcho_1090  hypothetical protein  56.52 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2339  hypothetical protein  66.67 
 
 		 297 aa  46.2  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0167  hypothetical protein  50 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2096  hypothetical protein  43.14 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0004226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1259  hypothetical protein  40.28 
 
 		 208 aa  45.4  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2731  hypothetical protein  39.68 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000468219  unclonable  0.000000144909 
 
 
 
NC_012918  GM21_0056  protein of unknown function DUF1555  26.85 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000096981 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1750  hypothetical protein  62.5 
 
 		 315 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489319  normal  0.427262 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2031  hypothetical protein  62.5 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2325  hypothetical protein  50 
 
 		 150 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0709  hypothetical protein  40 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1190  hypothetical protein  33.68 
 
 		 268 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100853  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  49.09 
 
 		 497 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1594  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1249  hypothetical protein  43.18 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2728  phosphatase-like  57.14 
 
 		 462 aa  42.4  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.427102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>