30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1594 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1594  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  362  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1593  hypothetical protein  40.22 
 
 		 188 aa  91.3  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2325  hypothetical protein  35.91 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1090  hypothetical protein  75.86 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2324  hypothetical protein  71.88 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2326  hypothetical protein  60.53 
 
 		 139 aa  51.2  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1067  hypothetical protein  63.33 
 
 		 202 aa  51.2  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1122  hypothetical protein  41.46 
 
 		 243 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.182832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2339  hypothetical protein  63.64 
 
 		 297 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2328  hypothetical protein  31.75 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2338  hypothetical protein  41.51 
 
 		 160 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1474  hypothetical protein  43.1 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0172447  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2327  hypothetical protein  44.9 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  54.55 
 
 		 497 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1249  hypothetical protein  57.5 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2427  hypothetical protein  34.62 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0532981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0167  hypothetical protein  63.89 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1059  hypothetical protein  30.85 
 
 		 303 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.548994  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1259  hypothetical protein  61.29 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0506  hypothetical protein  62.07 
 
 		 203 aa  44.7  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40604  normal  0.281124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1718  hypothetical protein  51.52 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000144169  unclonable  0.000000229382 
 
 
 
NC_010524  Lcho_1091  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0352  hypothetical protein  47.5 
 
 		 285 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.972359  normal  0.0160007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1598  hypothetical protein  48.72 
 
 		 263 aa  42.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000163018  unclonable  0.000000204973 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2397  hypothetical protein  58.62 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000007208  normal  1 
 
 
 
NC_007614  Nmul_A1261  hypothetical protein  54.84 
 
 		 269 aa  41.6  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0262  hypothetical protein  62.07 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000101412  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2031  hypothetical protein  60.71 
 
 		 179 aa  41.2  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1203  hypothetical protein  61.29 
 
 		 242 aa  40.8  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.743996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1713  hypothetical protein  43.59 
 
 		 270 aa  40.8  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>