40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0506 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0506  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  410  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40604  normal  0.281124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0505  hypothetical protein  48.6 
 
 
210 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.269231 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2296  protein of unknown function DUF1555  35.96 
 
 
195 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0648  hypothetical protein  48.28 
 
 
184 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2252  hypothetical protein  45.83 
 
 
233 aa  55.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1800  hypothetical protein  78.57 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444481  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1067  hypothetical protein  67.74 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1713  hypothetical protein  76 
 
 
270 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2031  hypothetical protein  47.62 
 
 
179 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1803  hypothetical protein  76.92 
 
 
266 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  71.43 
 
 
326 aa  48.9  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  64.52 
 
 
497 aa  48.9  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2427  hypothetical protein  68.97 
 
 
231 aa  48.5  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0532981  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2325  hypothetical protein  73.08 
 
 
150 aa  48.1  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0167  hypothetical protein  67.86 
 
 
239 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0262  hypothetical protein  46.38 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000101412  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2338  hypothetical protein  61.54 
 
 
160 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2728  phosphatase-like  65.52 
 
 
462 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.427102  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1090  hypothetical protein  73.08 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0352  hypothetical protein  65.52 
 
 
285 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.972359  normal  0.0160007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1122  hypothetical protein  67.74 
 
 
243 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.182832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2339  hypothetical protein  69.23 
 
 
297 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2328  hypothetical protein  64.29 
 
 
181 aa  46.2  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2324  hypothetical protein  68.97 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2578  hypothetical protein  66.67 
 
 
294 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1804  hypothetical protein  35.71 
 
 
227 aa  45.4  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.206043  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1123  hypothetical protein  64.52 
 
 
242 aa  44.7  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1249  hypothetical protein  68 
 
 
214 aa  45.1  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1259  hypothetical protein  61.29 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1594  hypothetical protein  62.07 
 
 
182 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1261  hypothetical protein  69.23 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1593  hypothetical protein  60.71 
 
 
188 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157492 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0803  hypothetical protein  66.67 
 
 
300 aa  42  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2326  hypothetical protein  57.14 
 
 
139 aa  42  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2327  hypothetical protein  53.57 
 
 
206 aa  41.6  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2005  hypothetical protein  64.29 
 
 
148 aa  41.6  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00997836  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  66.67 
 
 
288 aa  41.6  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1091  hypothetical protein  45.65 
 
 
229 aa  41.2  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0088  hypothetical protein  30.09 
 
 
211 aa  41.2  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0709  hypothetical protein  57.14 
 
 
261 aa  41.2  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>