17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1804 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1804  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  437  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.206043  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2252  hypothetical protein  36.57 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2325  hypothetical protein  50 
 
 
150 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  64.52 
 
 
497 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2339  hypothetical protein  57.58 
 
 
297 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1090  hypothetical protein  48.78 
 
 
223 aa  46.2  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0506  hypothetical protein  34.82 
 
 
203 aa  46.2  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40604  normal  0.281124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2338  hypothetical protein  57.58 
 
 
160 aa  45.1  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1803  hypothetical protein  79.17 
 
 
266 aa  45.1  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2578  hypothetical protein  62.96 
 
 
294 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1800  hypothetical protein  73.08 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444481  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0352  hypothetical protein  65.62 
 
 
285 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.972359  normal  0.0160007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1122  hypothetical protein  35.06 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.182832 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1713  hypothetical protein  66.67 
 
 
270 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2326  hypothetical protein  57.58 
 
 
139 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1067  hypothetical protein  68 
 
 
202 aa  42.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2328  hypothetical protein  72 
 
 
181 aa  42  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>