23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2252 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2252  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1804  hypothetical protein  36.25 
 
 
227 aa  101  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.206043  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0506  hypothetical protein  45.83 
 
 
203 aa  55.5  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40604  normal  0.281124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1800  hypothetical protein  35.82 
 
 
209 aa  53.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444481  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2325  hypothetical protein  64.71 
 
 
150 aa  53.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1805  hypothetical protein  27.27 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.951726  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1713  hypothetical protein  39.02 
 
 
270 aa  48.9  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0167  hypothetical protein  59.38 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2338  hypothetical protein  54.84 
 
 
160 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1090  hypothetical protein  66.67 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0709  hypothetical protein  66.67 
 
 
261 aa  46.2  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163058  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2339  hypothetical protein  66.67 
 
 
297 aa  45.4  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1067  hypothetical protein  69.23 
 
 
202 aa  45.4  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  45.83 
 
 
497 aa  45.4  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1803  hypothetical protein  75 
 
 
266 aa  45.4  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2427  hypothetical protein  55.88 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0532981  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0262  hypothetical protein  72.41 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000101412  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2328  hypothetical protein  56.67 
 
 
181 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  68 
 
 
326 aa  42.7  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2096  hypothetical protein  44.44 
 
 
259 aa  42.4  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0004226  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2728  phosphatase-like  51.52 
 
 
462 aa  42.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.427102  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2031  hypothetical protein  42.11 
 
 
179 aa  42.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0352  hypothetical protein  57.14 
 
 
285 aa  42  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.972359  normal  0.0160007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>