41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37354 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_37354  predicted protein  100 
 
 		 150 aa  309  9e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0263858  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  41.51 
 
 		 862 aa  77  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  41.67 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0634  CHRD domain containing protein  40.24 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231612  normal  0.156078 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  33.64 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  31.25 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4065  hypothetical protein  39.02 
 
 		 144 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435271  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2966  hypothetical protein  33.62 
 
 		 173 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  36.59 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3444  CHRD domain containing protein  33.93 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6737  CHRD domain-containing protein  32.86 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  32.41 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  33.88 
 
 		 479 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6077  CHRD domain-containing protein  36.59 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.563536 
 
 
-
 
NC_004310  BR0022  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0352588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0019  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2748  CHRD domain-containing protein  34.38 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2774  CHRD domain-containing protein  34.38 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2136  CHRD domain-containing protein  34.38 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0551  CHRD domain-containing protein  35.37 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0170  hypothetical protein  33.77 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2798  CHRD domain-containing protein  34.15 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.885551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2665  CHRD domain-containing protein  34.15 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0826  hypothetical protein  33.77 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0538  CHRD domain-containing superfamily  36.36 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2381  CHRD domain-containing protein  33.77 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.740751  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0666  CHRD domain-containing protein  33.77 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0650  CHRD domain-containing protein  33.77 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2301  CHRD domain-containing protein  33.77 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.712267  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2778  CHRD domain-containing protein  33.77 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3954  CHRD domain containing protein  34.86 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal  0.0638434 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2226  CHRD  38.96 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156145  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2218  CHRD domain containing protein  35.65 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3001  chordin  30.36 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1174  CHRD domain containing protein  29.7 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0629286  normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5363  CHRD domain containing protein  30.7 
 
 		 282 aa  47.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.974056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  33.03 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  30.08 
 
 		 407 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0541  CHRD domain containing protein  29.17 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.9695  normal  0.973428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1896  CHRD domain-containing protein  32.28 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  29.63 
 
 		 513 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>