26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1194 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1194  hypothetical protein  100 
 
 
531 aa  1045    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3954  CHRD domain containing protein  38.89 
 
 
145 aa  67.8  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal  0.0638434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2501  CHRD domain containing protein  36.52 
 
 
154 aa  67.4  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2087  CHRD domain containing protein  39.22 
 
 
729 aa  64.7  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.090076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2374  CHRD domain containing protein  46.43 
 
 
174 aa  61.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000109429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0338  CHRD domain containing protein  27.54 
 
 
154 aa  54.3  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  31.09 
 
 
479 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  36.23 
 
 
513 aa  52  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2096  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1080  CHRD  33.79 
 
 
141 aa  50.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2427  hypothetical protein  32.46 
 
 
132 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0731  hypothetical protein  39.05 
 
 
262 aa  48.5  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.166542  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2111  hypothetical protein  32.46 
 
 
132 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000509964  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1196  hypothetical protein  31.87 
 
 
151 aa  48.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.527838 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2354  hypothetical protein  32.46 
 
 
132 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2332  hypothetical protein  32.46 
 
 
132 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2066  hypothetical protein  37.68 
 
 
150 aa  48.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2174  hypothetical protein  32.46 
 
 
132 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.324144  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  30.58 
 
 
819 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2082  hypothetical protein  28.4 
 
 
199 aa  45.8  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114643  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3037  CHRD domain-containing protein  29.09 
 
 
170 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3145  CHRD  33.33 
 
 
413 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0444  CHRD domain-containing protein  30.61 
 
 
151 aa  44.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182512  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0359  CHRD domain-containing protein  29.66 
 
 
144 aa  43.9  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1308  CHRD  32.17 
 
 
140 aa  43.9  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.971052  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3258  CHRD domain containing protein  30.7 
 
 
411 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>