14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4532 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4532  hypothetical protein  100 
 
 
774 aa  1569    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3988  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  41.64 
 
 
601 aa  167  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1996  hypothetical protein  40.33 
 
 
900 aa  164  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17629  normal  0.339226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  40.43 
 
 
2003 aa  163  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1198  hypothetical protein  32.21 
 
 
470 aa  149  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.224504 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  38.41 
 
 
963 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.68 
 
 
1362 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  33.02 
 
 
1991 aa  107  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1799  hypothetical protein  29.24 
 
 
438 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.420989  normal  0.0134014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2180  hypothetical protein  26.73 
 
 
437 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0133963 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  41.48 
 
 
407 aa  80.5  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4516  putative esterase  41.04 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0801  hypothetical protein  38.35 
 
 
260 aa  76.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2518  hypothetical protein  31.88 
 
 
309 aa  52.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.744051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>