18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3988 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3988  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  100 
 
 
601 aa  1202    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  41.53 
 
 
1362 aa  219  8.999999999999998e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  41.74 
 
 
2003 aa  210  6e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  45.13 
 
 
963 aa  203  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  38.79 
 
 
1991 aa  183  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1996  hypothetical protein  37.63 
 
 
900 aa  176  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17629  normal  0.339226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4532  hypothetical protein  41.64 
 
 
774 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  41.55 
 
 
714 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0801  hypothetical protein  42.55 
 
 
260 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4516  putative esterase  39.16 
 
 
422 aa  100  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2518  hypothetical protein  34.5 
 
 
309 aa  92  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.744051 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  40 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3763  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  38.54 
 
 
387 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  34.34 
 
 
972 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  36 
 
 
470 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1253  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  33.77 
 
 
349 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.103761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1354  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  33.77 
 
 
349 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1887  hypothetical protein  35.09 
 
 
1290 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0257374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>