193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2265 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 963 aa  1871    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  47.77 
 
 		 1026 aa  460  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  42.57 
 
 		 1292 aa  411  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  39.44 
 
 		 1130 aa  378  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  43.94 
 
 		 652 aa  291  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  35.87 
 
 		 1750 aa  285  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  34.41 
 
 		 831 aa  284  5.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  35.26 
 
 		 930 aa  271  5e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  52.02 
 
 		 2296 aa  257  8e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  47.73 
 
 		 1051 aa  250  8e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  46.97 
 
 		 439 aa  250  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  47.69 
 
 		 646 aa  239  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  32.26 
 
 		 676 aa  234  5e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  31.47 
 
 		 668 aa  231  5e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  35.84 
 
 		 1030 aa  213  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  44.06 
 
 		 2003 aa  213  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.93 
 
 		 1362 aa  205  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3988  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  45.13 
 
 		 601 aa  201  7e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  40.77 
 
 		 1991 aa  187  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1996  hypothetical protein  40.66 
 
 		 900 aa  181  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17629  normal  0.339226 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  35.24 
 
 		 1351 aa  181  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  29.32 
 
 		 1293 aa  180  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  39.05 
 
 		 892 aa  178  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  37.35 
 
 		 850 aa  177  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  27.43 
 
 		 588 aa  174  9e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  35.16 
 
 		 1763 aa  170  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  38.07 
 
 		 387 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  36.53 
 
 		 772 aa  164  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.78 
 
 		 693 aa  162  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  38.61 
 
 		 863 aa  154  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  35.85 
 
 		 359 aa  153  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4532  hypothetical protein  38.41 
 
 		 774 aa  144  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  34.07 
 
 		 346 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  36.19 
 
 		 522 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  35.58 
 
 		 627 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  26.26 
 
 		 1030 aa  135  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.33 
 
 		 343 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  31 
 
 		 2831 aa  132  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1291  hypothetical protein  29.86 
 
 		 510 aa  131  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.984868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  35.24 
 
 		 709 aa  129  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  35.05 
 
 		 579 aa  129  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  32.38 
 
 		 623 aa  129  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  38.48 
 
 		 460 aa  126  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  34.89 
 
 		 390 aa  125  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  35.56 
 
 		 487 aa  122  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  35.74 
 
 		 404 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4516  putative esterase  47.69 
 
 		 422 aa  116  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  34.93 
 
 		 807 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 930 aa  114  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  33.21 
 
 		 1046 aa  114  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33 
 
 		 493 aa  111  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  32.48 
 
 		 504 aa  112  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  32.95 
 
 		 2961 aa  111  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  28.35 
 
 		 448 aa  109  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  31.07 
 
 		 391 aa  108  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  28.78 
 
 		 2350 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  29.59 
 
 		 841 aa  106  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  35.06 
 
 		 1079 aa  104  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  31.52 
 
 		 425 aa  104  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  29.67 
 
 		 392 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  31.83 
 
 		 491 aa  103  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  33.33 
 
 		 644 aa  102  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 		 732 aa  101  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0801  hypothetical protein  45.26 
 
 		 260 aa  100  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  28.4 
 
 		 752 aa  99.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  31.17 
 
 		 503 aa  99.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  30.7 
 
 		 786 aa  99.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 		 756 aa  98.6  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 		 719 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  31.35 
 
 		 581 aa  97.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.66 
 
 		 639 aa  94.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 		 641 aa  92  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2518  hypothetical protein  37.5 
 
 		 309 aa  91.3  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744051 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13808  predicted protein  35.62 
 
 		 1675 aa  90.5  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0947447  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.15 
 
 		 612 aa  89.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  31.4 
 
 		 525 aa  89.4  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  32.11 
 
 		 498 aa  89  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  33.8 
 
 		 1163 aa  88.2  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  34.3 
 
 		 1146 aa  87  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.09 
 
 		 628 aa  85.5  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  26.43 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.01 
 
 		 612 aa  84.3  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  31.95 
 
 		 353 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.42 
 
 		 612 aa  82.4  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  28.72 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  31.6 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0567  NHL repeat containing protein  44.33 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00166551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  30.13 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  27.25 
 
 		 1834 aa  80.5  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  27.83 
 
 		 307 aa  80.1  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  32.83 
 
 		 1140 aa  79.7  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  31.01 
 
 		 672 aa  77.4  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  28.7 
 
 		 634 aa  77.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  30.39 
 
 		 664 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3618  hypothetical protein  26.2 
 
 		 362 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  28.21 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  25.9 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  26.23 
 
 		 805 aa  73.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2644  hypothetical protein  30 
 
 		 359 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0696665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  27.88 
 
 		 1916 aa  73.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>