78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1154 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  100 
 
 
1991 aa  3873    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  29.35 
 
 
3563 aa  416  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  29.35 
 
 
1280 aa  260  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  31.88 
 
 
1183 aa  234  9e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  29.11 
 
 
1027 aa  206  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  28.33 
 
 
1585 aa  200  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  27.83 
 
 
1588 aa  198  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  42.36 
 
 
963 aa  194  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3988  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  39.39 
 
 
601 aa  187  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1996  hypothetical protein  38.01 
 
 
900 aa  186  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17629  normal  0.339226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  42.31 
 
 
2003 aa  179  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.87 
 
 
1362 aa  170  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  27.9 
 
 
1176 aa  140  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.34 
 
 
1176 aa  135  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0361  hypothetical protein  26.32 
 
 
857 aa  130  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.687552  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  28.24 
 
 
1100 aa  119  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4532  hypothetical protein  33.87 
 
 
774 aa  115  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.1 
 
 
2807 aa  106  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4516  putative esterase  43.4 
 
 
422 aa  101  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0801  hypothetical protein  41.18 
 
 
260 aa  99.8  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  30.53 
 
 
2198 aa  99.4  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2365  hypothetical protein  26.09 
 
 
888 aa  97.8  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  30 
 
 
889 aa  97.1  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  29.8 
 
 
858 aa  95.5  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  29.03 
 
 
901 aa  95.1  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  30.1 
 
 
8871 aa  92.8  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  29.75 
 
 
1933 aa  92  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2518  hypothetical protein  33.14 
 
 
309 aa  88.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.744051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  30.49 
 
 
864 aa  87.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  27.75 
 
 
740 aa  84  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1784  hypothetical protein  26.33 
 
 
523 aa  83.2  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  29.38 
 
 
665 aa  81.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  30.31 
 
 
2467 aa  77.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  33.82 
 
 
943 aa  74.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  51.25 
 
 
2802 aa  73.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  43.97 
 
 
1869 aa  73.6  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  41.44 
 
 
887 aa  72  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3841  hypothetical protein  25.82 
 
 
1140 aa  72  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0865863  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1259  hypothetical protein  29.85 
 
 
734 aa  71.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331683  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  29.5 
 
 
1565 aa  70.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  31.54 
 
 
1009 aa  69.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5022  hypothetical protein  29.71 
 
 
425 aa  69.3  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2824  CHRD domain-containing protein  37.59 
 
 
407 aa  68.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227844  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  35.66 
 
 
1916 aa  66.2  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5988  hypothetical protein  30.38 
 
 
381 aa  65.9  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.253106 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  31.6 
 
 
1150 aa  65.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  39.02 
 
 
658 aa  63.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  27.52 
 
 
940 aa  62  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  63.64 
 
 
1848 aa  61.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1823  hypothetical protein  25.48 
 
 
646 aa  61.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  36.78 
 
 
677 aa  61.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  41.67 
 
 
535 aa  60.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1832  hypothetical protein  25.9 
 
 
661 aa  60.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0514384  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1136  hypothetical protein  28.01 
 
 
433 aa  60.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.063435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  26.01 
 
 
1134 aa  59.3  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  27.82 
 
 
2066 aa  57.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  26.32 
 
 
1068 aa  57.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0581  hypothetical protein  30.28 
 
 
403 aa  55.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  37.8 
 
 
535 aa  55.8  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5021  hypothetical protein  26.21 
 
 
569 aa  55.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196755  normal  0.0476496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  40 
 
 
1148 aa  53.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.65 
 
 
962 aa  52  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  39.76 
 
 
533 aa  52  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  25 
 
 
429 aa  49.7  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2590  hypothetical protein  26.18 
 
 
429 aa  49.7  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.62 
 
 
815 aa  49.7  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  35.85 
 
 
1030 aa  49.7  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  43.28 
 
 
840 aa  49.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  38.71 
 
 
672 aa  48.9  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  70.59 
 
 
1779 aa  48.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  49.06 
 
 
3542 aa  47.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  24.44 
 
 
1454 aa  48.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2202  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.73 
 
 
597 aa  47  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  72.41 
 
 
494 aa  46.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  36 
 
 
1879 aa  46.6  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3181  hypothetical protein  24.56 
 
 
687 aa  46.6  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  40.96 
 
 
1232 aa  46.2  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03520  bud site selection-related protein, putative  29.03 
 
 
1376 aa  45.8  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>