20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1823 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1832  hypothetical protein  82.84 
 
 		 661 aa  1077    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0514384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1823  hypothetical protein  100 
 
 		 646 aa  1295    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  35.98 
 
 		 943 aa  324  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5022  hypothetical protein  37.66 
 
 		 425 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0581  hypothetical protein  40.8 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  33.46 
 
 		 1565 aa  94.4  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  29.97 
 
 		 1916 aa  88.2  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  33.19 
 
 		 2066 aa  79.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2365  hypothetical protein  25.58 
 
 		 888 aa  70.5  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  29.6 
 
 		 1150 aa  66.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  35.06 
 
 		 1183 aa  64.3  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  25.48 
 
 		 1991 aa  61.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  31.09 
 
 		 3563 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1259  hypothetical protein  30.91 
 
 		 734 aa  56.2  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331683  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0361  hypothetical protein  31.65 
 
 		 857 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.687552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  28.57 
 
 		 1009 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5988  hypothetical protein  30.41 
 
 		 381 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  32.59 
 
 		 1280 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  30.49 
 
 		 740 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  25 
 
 		 1588 aa  45.8  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>