22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1784 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1784  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1061    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  27.85 
 
 		 3563 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1280 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0361  hypothetical protein  29.13 
 
 		 857 aa  89.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.687552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.78 
 
 		 1183 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  26.33 
 
 		 1991 aa  83.6  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1027 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.71 
 
 		 2807 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1585 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  32.31 
 
 		 1176 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1588 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  31.69 
 
 		 1933 aa  48.5  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  25.17 
 
 		 889 aa  47.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  34.15 
 
 		 1068 aa  47.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1100 aa  47  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  26.67 
 
 		 8871 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  25.53 
 
 		 2198 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1176 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  35.14 
 
 		 864 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  35.64 
 
 		 665 aa  45.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  25.13 
 
 		 901 aa  43.9  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  28.81 
 
 		 439 aa  43.5  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>