33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0361 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0361  hypothetical protein  100 
 
 
857 aa  1730    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.687552  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  30.29 
 
 
1280 aa  217  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  27.23 
 
 
3563 aa  209  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.85 
 
 
1183 aa  169  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  26.32 
 
 
1991 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1784  hypothetical protein  29.13 
 
 
523 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  29.06 
 
 
1027 aa  84.3  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  25.49 
 
 
1588 aa  65.1  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  22.76 
 
 
1176 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  31.66 
 
 
1585 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  31.85 
 
 
2807 aa  62.4  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  28.34 
 
 
864 aa  61.2  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  27.27 
 
 
858 aa  58.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  23.55 
 
 
665 aa  58.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  28.71 
 
 
1134 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  28.45 
 
 
2198 aa  56.6  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1832  hypothetical protein  29.44 
 
 
661 aa  55.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0514384  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  23.18 
 
 
1176 aa  55.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  28.84 
 
 
901 aa  53.9  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1823  hypothetical protein  31.65 
 
 
646 aa  52.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  28.57 
 
 
1933 aa  52.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5988  hypothetical protein  25.68 
 
 
381 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.253106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  23.26 
 
 
1100 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2590  hypothetical protein  25.64 
 
 
429 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  24.82 
 
 
889 aa  50.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.23 
 
 
8871 aa  50.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  27.27 
 
 
1068 aa  48.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2290  hypothetical protein  28.87 
 
 
726 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5021  hypothetical protein  24.6 
 
 
569 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196755  normal  0.0476496 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5022  hypothetical protein  25 
 
 
425 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3841  hypothetical protein  25.99 
 
 
1140 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0865863  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  29.07 
 
 
2467 aa  45.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  26.38 
 
 
943 aa  44.7  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>