73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1449 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  100 
 
 
1027 aa  2039    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  31.13 
 
 
3563 aa  246  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  29.26 
 
 
1280 aa  239  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  29.8 
 
 
1991 aa  206  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.21 
 
 
1183 aa  192  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  30.38 
 
 
864 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  45.14 
 
 
940 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  26.61 
 
 
1585 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  26.95 
 
 
1588 aa  108  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  30.57 
 
 
901 aa  108  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  33.52 
 
 
858 aa  108  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  35.77 
 
 
456 aa  106  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  31.32 
 
 
889 aa  105  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  28.23 
 
 
8871 aa  101  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  31.93 
 
 
2807 aa  99.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.94 
 
 
1176 aa  98.6  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  32.48 
 
 
2198 aa  96.3  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  37.95 
 
 
845 aa  94  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  36.67 
 
 
2002 aa  90.9  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  28.13 
 
 
1176 aa  90.1  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  33.72 
 
 
331 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2338  peptidase C10 streptopain  38.86 
 
 
841 aa  85.1  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.11 
 
 
1323 aa  84.7  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0361  hypothetical protein  29.06 
 
 
857 aa  84.3  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.687552  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  30.81 
 
 
1933 aa  84.3  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  44.03 
 
 
1263 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  38.41 
 
 
1390 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  32.63 
 
 
2467 aa  82.8  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  30.25 
 
 
665 aa  82  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  42.38 
 
 
998 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  26.53 
 
 
1100 aa  79.7  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.84 
 
 
726 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  33.53 
 
 
4357 aa  77.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1784  hypothetical protein  27.87 
 
 
523 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  35.23 
 
 
2082 aa  71.2  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  35.26 
 
 
835 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2586  hypothetical protein  35.71 
 
 
582 aa  69.7  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0849456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  42.95 
 
 
1004 aa  68.6  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.97 
 
 
607 aa  66.6  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  31.98 
 
 
1095 aa  67  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  30.18 
 
 
2117 aa  64.7  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5022  hypothetical protein  36.88 
 
 
425 aa  64.3  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  34.91 
 
 
429 aa  63.9  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  28.68 
 
 
608 aa  63.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  38.4 
 
 
1222 aa  62.4  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1367  cell wall/surface repeat-containing protein  31.88 
 
 
432 aa  60.1  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1621  hypothetical protein  27.46 
 
 
446 aa  58.9  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.967511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  44.83 
 
 
750 aa  58.9  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  45.57 
 
 
1076 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5246  hypothetical protein  38.27 
 
 
708 aa  56.2  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.733129 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1503  cell wall/surface repeat protein  27.44 
 
 
446 aa  56.2  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  31.18 
 
 
720 aa  55.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  39.6 
 
 
792 aa  55.1  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2590  hypothetical protein  27.14 
 
 
429 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  28.96 
 
 
1081 aa  53.5  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  29.87 
 
 
514 aa  53.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  31.17 
 
 
740 aa  53.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1857  hypothetical protein  31.76 
 
 
321 aa  52.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000442866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  21.91 
 
 
1523 aa  51.6  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  24.71 
 
 
1068 aa  51.2  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2365  hypothetical protein  28.82 
 
 
888 aa  50.8  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1832  hypothetical protein  33.33 
 
 
661 aa  49.7  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0514384  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  29.45 
 
 
943 aa  49.7  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5021  hypothetical protein  29.36 
 
 
569 aa  49.3  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196755  normal  0.0476496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  28.04 
 
 
1009 aa  48.9  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  23.56 
 
 
696 aa  48.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.8 
 
 
1364 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  26.21 
 
 
464 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1872  hypothetical protein  29.76 
 
 
848 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0860464 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3841  hypothetical protein  28.38 
 
 
1140 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0865863  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  24.68 
 
 
728 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  39.51 
 
 
1916 aa  45.4  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.06 
 
 
675 aa  45.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>