24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2365 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2365  hypothetical protein  100 
 
 		 888 aa  1767    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  26.97 
 
 		 740 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  25.99 
 
 		 1991 aa  97.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1259  hypothetical protein  29.13 
 
 		 734 aa  96.3  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5988  hypothetical protein  29.81 
 
 		 381 aa  88.6  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253106 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2802  hypothetical protein  25.76 
 
 		 841 aa  85.1  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  30.05 
 
 		 1565 aa  75.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1823  hypothetical protein  25.44 
 
 		 646 aa  70.1  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3841  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1140 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0865863  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1832  hypothetical protein  25.19 
 
 		 661 aa  68.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0514384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  28.8 
 
 		 1009 aa  66.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  27.55 
 
 		 3563 aa  62  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  28.47 
 
 		 2066 aa  60.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  29.82 
 
 		 1916 aa  58.9  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1134 aa  58.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  31.15 
 
 		 1150 aa  57.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  27.92 
 
 		 943 aa  55.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5022  hypothetical protein  24.94 
 
 		 425 aa  55.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1027 aa  50.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  23.4 
 
 		 1183 aa  49.3  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  20.87 
 
 		 1280 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0581  hypothetical protein  31.87 
 
 		 403 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1585 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0459  hypothetical protein  30.91 
 
 		 363 aa  45.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>