21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1832 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1832  hypothetical protein  100 
 
 		 661 aa  1320    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0514384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1823  hypothetical protein  84.08 
 
 		 646 aa  1069    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  35.71 
 
 		 943 aa  316  8e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5022  hypothetical protein  36.57 
 
 		 425 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0581  hypothetical protein  40.3 
 
 		 403 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  30.77 
 
 		 1565 aa  88.2  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  29.25 
 
 		 1916 aa  87.4  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  30.4 
 
 		 2066 aa  81.3  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2365  hypothetical protein  25.19 
 
 		 888 aa  68.6  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.77 
 
 		 1183 aa  65.1  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  29.43 
 
 		 3563 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  25.9 
 
 		 1991 aa  60.8  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  27.69 
 
 		 1150 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0361  hypothetical protein  28.51 
 
 		 857 aa  58.9  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.687552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5988  hypothetical protein  28.93 
 
 		 381 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253106 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1259  hypothetical protein  26.21 
 
 		 734 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1588 aa  52.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1280 aa  50.8  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1027 aa  49.7  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  26.54 
 
 		 1009 aa  47.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  31.36 
 
 		 740 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>