25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5022 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5022  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  853    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0581  hypothetical protein  50.12 
 
 		 403 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  42.19 
 
 		 943 aa  320  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1823  hypothetical protein  37.66 
 
 		 646 aa  259  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1832  hypothetical protein  36.57 
 
 		 661 aa  243  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0514384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  28.57 
 
 		 1565 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  28.1 
 
 		 1916 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  28.97 
 
 		 1150 aa  78.2  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  30.52 
 
 		 2066 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  29.71 
 
 		 1991 aa  70.1  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  36.88 
 
 		 1027 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  30.3 
 
 		 1009 aa  60.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1259  hypothetical protein  26.63 
 
 		 734 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331683  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.69 
 
 		 1183 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2365  hypothetical protein  24.94 
 
 		 888 aa  55.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5988  hypothetical protein  30.57 
 
 		 381 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  27.51 
 
 		 3563 aa  53.1  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1280 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1588 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3841  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1140 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0865863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  33.09 
 
 		 1134 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3181  hypothetical protein  27.33 
 
 		 687 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  23.68 
 
 		 740 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0361  hypothetical protein  25 
 
 		 857 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.687552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3824  hypothetical protein  29.37 
 
 		 726 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.510661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>