76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1825 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 1009 aa  1980    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  37.81 
 
 		 1565 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  34.73 
 
 		 1150 aa  345  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  33.53 
 
 		 2066 aa  339  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  34.12 
 
 		 1916 aa  312  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1831  hypothetical protein  43.29 
 
 		 711 aa  114  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0663  peptidase S26B, signal peptidase  33.2 
 
 		 618 aa  90.1  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.10738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  28.5 
 
 		 943 aa  79.7  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0628  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  34.23 
 
 		 574 aa  75.5  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  31.54 
 
 		 1991 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2365  hypothetical protein  28.8 
 
 		 888 aa  70.1  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  30.23 
 
 		 3273 aa  66.6  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5988  hypothetical protein  36.64 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253106 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5022  hypothetical protein  29.87 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  27.59 
 
 		 458 aa  60.1  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  33.59 
 
 		 3802 aa  57.4  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1823  hypothetical protein  28.57 
 
 		 646 aa  57.4  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  31.48 
 
 		 455 aa  56.2  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  31.06 
 
 		 455 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  29.01 
 
 		 4761 aa  55.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  31.06 
 
 		 455 aa  56.2  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  31.48 
 
 		 455 aa  56.2  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  31.68 
 
 		 455 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  31.68 
 
 		 455 aa  55.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  32.74 
 
 		 787 aa  54.7  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  30.86 
 
 		 455 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  30.43 
 
 		 455 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1078  Laminin G sub domain 2  28.24 
 
 		 911 aa  53.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.476778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  44.09 
 
 		 429 aa  53.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1259  hypothetical protein  26.89 
 
 		 734 aa  52.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331683  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  40.38 
 
 		 2170 aa  52.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  39.09 
 
 		 743 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  33.83 
 
 		 3563 aa  52.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  30.25 
 
 		 455 aa  52  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  37 
 
 		 749 aa  52  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  29.81 
 
 		 455 aa  52  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  29.63 
 
 		 455 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2131  Laminin G sub domain 2  32.43 
 
 		 981 aa  51.2  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.38 
 
 		 1448 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1832  hypothetical protein  26.92 
 
 		 661 aa  50.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0514384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.86 
 
 		 809 aa  51.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  36 
 
 		 660 aa  50.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1027 aa  49.7  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  44.21 
 
 		 847 aa  49.7  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1585 aa  49.3  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  26.53 
 
 		 458 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  46.07 
 
 		 658 aa  49.3  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  37.38 
 
 		 997 aa  48.9  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  45.26 
 
 		 1121 aa  48.5  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  29.52 
 
 		 456 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  37.89 
 
 		 703 aa  48.1  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  42.2 
 
 		 680 aa  48.1  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  39.81 
 
 		 978 aa  48.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  34.53 
 
 		 1131 aa  47.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  29 
 
 		 740 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  36.44 
 
 		 1887 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.56 
 
 		 6885 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  33.7 
 
 		 3907 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1588 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  27.11 
 
 		 456 aa  47  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  34.69 
 
 		 667 aa  47  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  30.99 
 
 		 1695 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2290  hypothetical protein  31.25 
 
 		 726 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3181  hypothetical protein  37.33 
 
 		 687 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  41.86 
 
 		 649 aa  45.8  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  29.22 
 
 		 4357 aa  45.8  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  32.95 
 
 		 1847 aa  45.8  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  29.63 
 
 		 420 aa  45.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  36.89 
 
 		 1199 aa  45.1  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.81 
 
 		 729 aa  45.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  34.31 
 
 		 552 aa  45.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  41.05 
 
 		 438 aa  44.7  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  29.52 
 
 		 1577 aa  44.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  41.3 
 
 		 973 aa  44.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 459 aa  44.7  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1130  hypothetical protein  28.71 
 
 		 285 aa  44.7  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>