82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1371 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  84.4 
 
 		 1585 aa  2544    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  100 
 
 		 1588 aa  3168    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  36.28 
 
 		 2192 aa  247  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  35.03 
 
 		 2042 aa  241  9e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  28.29 
 
 		 1991 aa  200  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  34.97 
 
 		 1804 aa  187  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  41.89 
 
 		 1439 aa  186  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  38.22 
 
 		 2042 aa  182  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  28.01 
 
 		 3563 aa  167  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  38.22 
 
 		 777 aa  153  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  33.52 
 
 		 1902 aa  151  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  37.69 
 
 		 2528 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  36.88 
 
 		 1951 aa  149  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  35.37 
 
 		 916 aa  145  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1280 aa  141  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  36.4 
 
 		 549 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.4 
 
 		 1183 aa  135  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  36.26 
 
 		 898 aa  127  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  25.84 
 
 		 913 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1027 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  30.38 
 
 		 899 aa  108  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  34.82 
 
 		 1526 aa  103  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  36.19 
 
 		 1275 aa  90.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  29.4 
 
 		 888 aa  90.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  36.56 
 
 		 1848 aa  79.7  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  25.26 
 
 		 3586 aa  77.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.62 
 
 		 1176 aa  75.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  37.93 
 
 		 1241 aa  74.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  25.31 
 
 		 1047 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  45.71 
 
 		 906 aa  73.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  31.75 
 
 		 2927 aa  73.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  29.19 
 
 		 937 aa  71.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1796  Fibronectin type III domain protein  29.56 
 
 		 694 aa  70.1  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303311  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.56 
 
 		 4500 aa  66.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0361  hypothetical protein  24.95 
 
 		 857 aa  66.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.687552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  25.74 
 
 		 864 aa  65.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  27.43 
 
 		 889 aa  65.5  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1176 aa  63.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  24.93 
 
 		 8871 aa  62  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  28.5 
 
 		 696 aa  61.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  45.71 
 
 		 983 aa  61.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  33.91 
 
 		 2117 aa  60.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1583  cytochrome c, class I  37.35 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000740916  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  29.9 
 
 		 665 aa  58.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4062  hypothetical protein  36.25 
 
 		 711 aa  58.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  29.55 
 
 		 858 aa  57.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5021  hypothetical protein  26.51 
 
 		 569 aa  57.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196755  normal  0.0476496 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  30.35 
 
 		 3089 aa  57  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  28.33 
 
 		 3544 aa  57  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  31.72 
 
 		 6109 aa  56.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  38.36 
 
 		 482 aa  56.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.07 
 
 		 2807 aa  54.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  41.18 
 
 		 2522 aa  53.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1933 aa  53.9  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  27.13 
 
 		 2467 aa  53.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  29.57 
 
 		 2716 aa  53.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  30.73 
 
 		 3925 aa  53.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  27.57 
 
 		 2503 aa  53.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  30.08 
 
 		 1461 aa  53.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1832  hypothetical protein  27.04 
 
 		 661 aa  52  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0514384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  28.93 
 
 		 1532 aa  51.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  34.48 
 
 		 2296 aa  52  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  21.43 
 
 		 1332 aa  50.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  32.7 
 
 		 1565 aa  50.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5988  hypothetical protein  30.66 
 
 		 381 aa  50.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  26.55 
 
 		 943 aa  50.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  27.57 
 
 		 3699 aa  49.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  26.44 
 
 		 901 aa  50.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  26.86 
 
 		 740 aa  49.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1100 aa  49.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1784  hypothetical protein  23.81 
 
 		 523 aa  49.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2802  hypothetical protein  30.16 
 
 		 841 aa  49.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5022  hypothetical protein  29.49 
 
 		 425 aa  49.3  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  39.42 
 
 		 857 aa  48.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  34.34 
 
 		 1371 aa  47  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  27 
 
 		 2350 aa  47  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  26.87 
 
 		 1009 aa  46.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  34.18 
 
 		 1911 aa  45.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1259  hypothetical protein  28.94 
 
 		 734 aa  45.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331683  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  32.95 
 
 		 1391 aa  45.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  23.79 
 
 		 2198 aa  45.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 		 2262 aa  45.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>