More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2684 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  63.74 
 
 		 649 aa  779    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 658 aa  1348    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  69.86 
 
 		 619 aa  619  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  63.7 
 
 		 597 aa  550  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  61.65 
 
 		 580 aa  543  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  62.72 
 
 		 633 aa  543  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  55.06 
 
 		 526 aa  504  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  51.85 
 
 		 1414 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  46.58 
 
 		 566 aa  415  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  46.4 
 
 		 534 aa  412  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  48.13 
 
 		 468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  44.02 
 
 		 563 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  43.61 
 
 		 539 aa  372  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  46.13 
 
 		 660 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  34.92 
 
 		 608 aa  310  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  36.39 
 
 		 2305 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  35.7 
 
 		 562 aa  204  6e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  34.63 
 
 		 542 aa  200  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  34.12 
 
 		 2310 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  30.48 
 
 		 480 aa  151  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  31.12 
 
 		 496 aa  150  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  45.27 
 
 		 847 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  30.38 
 
 		 614 aa  145  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  46.98 
 
 		 543 aa  143  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  43.56 
 
 		 681 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  44.76 
 
 		 655 aa  138  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  46.04 
 
 		 978 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  45.5 
 
 		 900 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  44.14 
 
 		 743 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  29.65 
 
 		 523 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  41.86 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  44.02 
 
 		 460 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.54 
 
 		 998 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  44.57 
 
 		 727 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  37.7 
 
 		 438 aa  103  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  53 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  37.62 
 
 		 1137 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  50 
 
 		 372 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  58.06 
 
 		 593 aa  101  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  25.94 
 
 		 440 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  40.76 
 
 		 543 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  33.17 
 
 		 880 aa  100  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  53 
 
 		 422 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  53 
 
 		 474 aa  99.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  38.33 
 
 		 1121 aa  99.4  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  50 
 
 		 448 aa  97.8  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  32.44 
 
 		 674 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  48 
 
 		 493 aa  96.3  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  26.84 
 
 		 632 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  33.33 
 
 		 637 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  42.41 
 
 		 973 aa  94  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  30.65 
 
 		 674 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  30.92 
 
 		 674 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  29.5 
 
 		 674 aa  90.5  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  29.5 
 
 		 674 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  29.5 
 
 		 674 aa  88.6  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  31.79 
 
 		 674 aa  89  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  29.5 
 
 		 674 aa  88.6  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  29.5 
 
 		 674 aa  88.6  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  29.66 
 
 		 674 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  38.64 
 
 		 938 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  47.06 
 
 		 673 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  46.08 
 
 		 460 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0861  glycoside hydrolase family 5  25.51 
 
 		 642 aa  85.5  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.025002 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  46.88 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  26.68 
 
 		 725 aa  84  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  35.35 
 
 		 699 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  46.39 
 
 		 451 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  37.44 
 
 		 1007 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  31.61 
 
 		 674 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  49.5 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  34.42 
 
 		 719 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  48.45 
 
 		 906 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  46.08 
 
 		 1154 aa  78.2  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  49.52 
 
 		 552 aa  78.2  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  48.62 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  41.96 
 
 		 702 aa  77.8  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  45.98 
 
 		 360 aa  76.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  43.3 
 
 		 477 aa  76.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  37.01 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  43.56 
 
 		 763 aa  75.5  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  43.81 
 
 		 756 aa  75.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  42.27 
 
 		 678 aa  75.1  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  45.36 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  45.45 
 
 		 820 aa  74.7  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  42.27 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  45.28 
 
 		 2286 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  36.79 
 
 		 925 aa  73.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  42.27 
 
 		 656 aa  73.2  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  44.21 
 
 		 458 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  41.11 
 
 		 773 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  41 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  41.05 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  41.07 
 
 		 749 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  31.55 
 
 		 679 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  40.38 
 
 		 459 aa  72  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  43.14 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  42.86 
 
 		 911 aa  72  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  39.1 
 
 		 614 aa  72  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>