143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2872 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 566 aa  1162    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  78.22 
 
 		 468 aa  768    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  71.92 
 
 		 534 aa  818    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  55.34 
 
 		 526 aa  585  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  45.78 
 
 		 563 aa  491  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  52.85 
 
 		 1414 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  52.8 
 
 		 619 aa  465  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  49.01 
 
 		 633 aa  453  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  48.59 
 
 		 649 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  50.11 
 
 		 580 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  50.93 
 
 		 597 aa  428  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  41.55 
 
 		 539 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  48.39 
 
 		 658 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  43.29 
 
 		 660 aa  395  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  33.66 
 
 		 562 aa  209  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  32.84 
 
 		 608 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  32.46 
 
 		 542 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  32.93 
 
 		 2310 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  33.02 
 
 		 2305 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  29.41 
 
 		 480 aa  144  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  29.85 
 
 		 496 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  30.52 
 
 		 614 aa  140  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  26.58 
 
 		 725 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  25.98 
 
 		 440 aa  97.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  24.28 
 
 		 440 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  50 
 
 		 922 aa  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  49.57 
 
 		 554 aa  88.2  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  40.54 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  43.52 
 
 		 707 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  56.41 
 
 		 895 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  42.4 
 
 		 736 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  57.35 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  45.45 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  51.85 
 
 		 591 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  53.73 
 
 		 1224 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  49 
 
 		 582 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  42.35 
 
 		 600 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  59.09 
 
 		 789 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.72 
 
 		 710 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  32.96 
 
 		 639 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  58.57 
 
 		 630 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  54.69 
 
 		 742 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  53.42 
 
 		 649 aa  77.8  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  56.92 
 
 		 730 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  53.52 
 
 		 814 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  33.54 
 
 		 411 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  38.52 
 
 		 842 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  50.62 
 
 		 741 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  56.92 
 
 		 928 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  55.22 
 
 		 537 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.16 
 
 		 831 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  39.64 
 
 		 334 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  43.48 
 
 		 710 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  52.94 
 
 		 1051 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 590 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  56.16 
 
 		 580 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 		 739 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  50.79 
 
 		 982 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  35.96 
 
 		 611 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  44.62 
 
 		 715 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  51.56 
 
 		 533 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 		 1077 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  47.76 
 
 		 567 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  50 
 
 		 900 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  43.53 
 
 		 558 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  53.97 
 
 		 837 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  52.17 
 
 		 820 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  44.3 
 
 		 773 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  40.26 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  39.51 
 
 		 1601 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  30.11 
 
 		 948 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  48.44 
 
 		 571 aa  64.3  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2038  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.14 
 
 		 807 aa  63.5  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  50.79 
 
 		 679 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  45.33 
 
 		 619 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  45.31 
 
 		 599 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  52.54 
 
 		 501 aa  61.6  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.78 
 
 		 790 aa  61.2  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  39.47 
 
 		 583 aa  60.8  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  51.61 
 
 		 533 aa  60.5  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  55.17 
 
 		 528 aa  60.5  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  42.25 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  48.39 
 
 		 928 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2549  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.06 
 
 		 324 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  43.48 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.97 
 
 		 511 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  35.23 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 961 aa  57.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  22.54 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  49.15 
 
 		 965 aa  57.4  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  21.46 
 
 		 632 aa  57.4  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  36.36 
 
 		 725 aa  57  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  42.11 
 
 		 707 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  40.3 
 
 		 780 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  41.79 
 
 		 532 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  47.62 
 
 		 435 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 		 683 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  36.11 
 
 		 295 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  39.39 
 
 		 686 aa  54.3  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  36.99 
 
 		 848 aa  54.3  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>