30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0861 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0861  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 642 aa  1313    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.025002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  49.3 
 
 		 632 aa  614  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  29.78 
 
 		 562 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  28.86 
 
 		 608 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  26.71 
 
 		 2305 aa  101  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  28.5 
 
 		 542 aa  99  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  23.74 
 
 		 660 aa  88.6  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  26.38 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09166  cellulase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14560)  23.47 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110672  normal  0.0495135 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  32.43 
 
 		 584 aa  84.7  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  26.24 
 
 		 2310 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  25.66 
 
 		 658 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  24.34 
 
 		 649 aa  82.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  32.97 
 
 		 584 aa  81.6  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  25.63 
 
 		 614 aa  78.6  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 440 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  26.36 
 
 		 597 aa  75.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  26.1 
 
 		 580 aa  73.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  25.11 
 
 		 526 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  26.44 
 
 		 619 aa  71.2  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  22.95 
 
 		 633 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  23.69 
 
 		 563 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  29.61 
 
 		 496 aa  68.6  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  25.96 
 
 		 1414 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  23.47 
 
 		 539 aa  60.8  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04177  cellulase  24.89 
 
 		 590 aa  52  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  20.22 
 
 		 534 aa  50.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  20.66 
 
 		 566 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  23.59 
 
 		 468 aa  44.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>