135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2102 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2102  cellulase  100 
 
 
496 aa  1005    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  64.17 
 
 
480 aa  610  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  65.83 
 
 
614 aa  500  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  44.06 
 
 
608 aa  276  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  44.15 
 
 
562 aa  268  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  37.07 
 
 
542 aa  266  8e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  43.37 
 
 
2305 aa  256  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  41.16 
 
 
2310 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04177  cellulase  37.98 
 
 
590 aa  213  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  34.24 
 
 
584 aa  200  5e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  34.17 
 
 
584 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  34.59 
 
 
660 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  30.69 
 
 
1414 aa  182  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  32.98 
 
 
597 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  32.19 
 
 
649 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  30.93 
 
 
619 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 
526 aa  174  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  31.87 
 
 
633 aa  169  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  32.27 
 
 
580 aa  164  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  31.3 
 
 
658 aa  163  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  30.1 
 
 
566 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  29.31 
 
 
534 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  28.47 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  27.06 
 
 
563 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  29.97 
 
 
539 aa  137  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  27.17 
 
 
725 aa  133  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.63 
 
 
639 aa  97.8  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  45.63 
 
 
628 aa  97.1  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  50 
 
 
572 aa  92.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  31.46 
 
 
632 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3396  rare lipoprotein A  54.05 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.160784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3317  Protein of unknown function DUF1592  50 
 
 
811 aa  84  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0861  glycoside hydrolase family 5  29.02 
 
 
642 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.025002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  23.7 
 
 
440 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 
440 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  35.04 
 
 
846 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  41.1 
 
 
990 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  33.04 
 
 
609 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  47.95 
 
 
1186 aa  62  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  38.83 
 
 
794 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  43.66 
 
 
598 aa  61.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  23.45 
 
 
814 aa  60.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  44.16 
 
 
1137 aa  60.1  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  44.44 
 
 
371 aa  60.1  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  29.69 
 
 
792 aa  58.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  42.67 
 
 
1209 aa  58.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  36.96 
 
 
466 aa  57  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  24.19 
 
 
365 aa  55.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  39.47 
 
 
966 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  34.78 
 
 
637 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  37.23 
 
 
773 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  41.1 
 
 
938 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  34.94 
 
 
854 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  34.74 
 
 
486 aa  54.3  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  41.33 
 
 
467 aa  53.9  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  36.9 
 
 
465 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  41.67 
 
 
894 aa  53.9  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1882  hypothetical protein  25.81 
 
 
476 aa  53.5  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1893  hypothetical protein  25.81 
 
 
476 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  31.34 
 
 
468 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  44.29 
 
 
791 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  39.76 
 
 
488 aa  52.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  39.76 
 
 
479 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  38.36 
 
 
596 aa  52.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  38.36 
 
 
590 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  38.03 
 
 
880 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  44.29 
 
 
727 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  36 
 
 
963 aa  51.6  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2939  ATPase  39.47 
 
 
787 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  32.94 
 
 
364 aa  50.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  35.14 
 
 
491 aa  50.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  35.92 
 
 
694 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  28.5 
 
 
853 aa  50.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  41.67 
 
 
366 aa  50.1  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.14 
 
 
588 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  36.11 
 
 
1128 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  39.19 
 
 
376 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.49 
 
 
673 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  31.19 
 
 
812 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  32.05 
 
 
778 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.43 
 
 
867 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  40.96 
 
 
1121 aa  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  33.33 
 
 
744 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.44 
 
 
633 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  31.03 
 
 
503 aa  48.1  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.03 
 
 
984 aa  48.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  39.73 
 
 
743 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  34.88 
 
 
679 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  37.18 
 
 
436 aa  47.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  39.44 
 
 
851 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  38.46 
 
 
525 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  38.75 
 
 
699 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  33.75 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  35.44 
 
 
1007 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  37.14 
 
 
511 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
462 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  36.11 
 
 
842 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  36.05 
 
 
494 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4285  cellulose-binding family II  37.18 
 
 
472 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  34.15 
 
 
487 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>