257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0734 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  58.22 
 
 		 597 aa  689    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 580 aa  1177    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  69.47 
 
 		 619 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  61.48 
 
 		 658 aa  542  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  61.48 
 
 		 633 aa  541  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  47.63 
 
 		 649 aa  535  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  49.35 
 
 		 526 aa  477  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  52.28 
 
 		 1414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  46.15 
 
 		 534 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  50.11 
 
 		 566 aa  425  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  47.02 
 
 		 468 aa  420  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  45.31 
 
 		 563 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  46.8 
 
 		 660 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  44.14 
 
 		 539 aa  369  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  35.44 
 
 		 608 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  36.39 
 
 		 2305 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  35.96 
 
 		 2310 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  36.34 
 
 		 542 aa  211  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  28.22 
 
 		 496 aa  157  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  31.37 
 
 		 480 aa  152  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  65.35 
 
 		 934 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  29.93 
 
 		 614 aa  139  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  62.14 
 
 		 842 aa  134  6.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  62.14 
 
 		 623 aa  133  6.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  56.03 
 
 		 998 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  48.08 
 
 		 489 aa  113  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  42.36 
 
 		 846 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  49.5 
 
 		 990 aa  111  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  50 
 
 		 875 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  48.11 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  49.04 
 
 		 775 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  50 
 
 		 880 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  27.53 
 
 		 440 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  52.48 
 
 		 963 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  50.5 
 
 		 393 aa  105  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  51 
 
 		 966 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  27.93 
 
 		 440 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  48 
 
 		 596 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  42.31 
 
 		 442 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  37.5 
 
 		 609 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  49.06 
 
 		 785 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  51.96 
 
 		 979 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  50.5 
 
 		 688 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  49 
 
 		 432 aa  99  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  45.28 
 
 		 854 aa  98.2  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.52 
 
 		 590 aa  97.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  45.28 
 
 		 690 aa  97.4  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  46.08 
 
 		 620 aa  97.4  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  50.98 
 
 		 488 aa  97.1  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  49.51 
 
 		 494 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  41.9 
 
 		 628 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  44.95 
 
 		 727 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  37.5 
 
 		 389 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  45.28 
 
 		 646 aa  95.9  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  46 
 
 		 436 aa  95.1  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  47.52 
 
 		 518 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  44.04 
 
 		 436 aa  94.7  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  45.19 
 
 		 854 aa  94.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  47.52 
 
 		 767 aa  94.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  43.81 
 
 		 913 aa  93.6  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  45.54 
 
 		 743 aa  93.6  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.06 
 
 		 479 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  28.99 
 
 		 632 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  51.11 
 
 		 938 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  47.52 
 
 		 681 aa  93.6  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  42.45 
 
 		 746 aa  92.8  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.14 
 
 		 984 aa  92.8  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  41.28 
 
 		 669 aa  92.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  46.53 
 
 		 778 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  40 
 
 		 942 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  46 
 
 		 588 aa  92.8  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  48.04 
 
 		 611 aa  91.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  44.12 
 
 		 744 aa  92  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.61 
 
 		 499 aa  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.55 
 
 		 469 aa  91.3  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  39.68 
 
 		 694 aa  90.9  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  44.66 
 
 		 681 aa  90.5  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  42.57 
 
 		 842 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  42.59 
 
 		 438 aa  89  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  45.1 
 
 		 589 aa  89.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  43.14 
 
 		 774 aa  88.6  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  42 
 
 		 894 aa  88.6  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  43.01 
 
 		 598 aa  88.6  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  36.92 
 
 		 812 aa  88.6  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  48.35 
 
 		 366 aa  87.8  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  44.14 
 
 		 605 aa  87.8  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  38.24 
 
 		 487 aa  87.8  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.14 
 
 		 491 aa  87  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  41.59 
 
 		 486 aa  87  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  39.62 
 
 		 543 aa  87  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  42.16 
 
 		 1128 aa  87  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  41.75 
 
 		 488 aa  86.7  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  43.14 
 
 		 925 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  41.9 
 
 		 864 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  45.74 
 
 		 763 aa  85.9  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  43.4 
 
 		 894 aa  86.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  34.65 
 
 		 468 aa  86.3  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  41.58 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  45.74 
 
 		 1209 aa  85.5  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  42.99 
 
 		 495 aa  85.5  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>