43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1958 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  100 
 
 		 584 aa  1204    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  97.43 
 
 		 584 aa  1171    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04177  cellulase  42.5 
 
 		 590 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0818  putative endoglucanase protein  58.54 
 
 		 256 aa  294  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2115  Rare lipoprotein A  52.02 
 
 		 231 aa  216  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.27237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2380  Rare lipoprotein A  48.99 
 
 		 229 aa  210  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2092  Rare lipoprotein A  48.48 
 
 		 229 aa  207  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  32.95 
 
 		 480 aa  184  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  35.1 
 
 		 496 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  34.23 
 
 		 614 aa  177  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2307  rare lipoprotein A  36.79 
 
 		 237 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1550  rare lipoprotein A  35.68 
 
 		 238 aa  134  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.662053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40.44 
 
 		 477 aa  127  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5557  rare lipoprotein A  40.88 
 
 		 293 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  39.25 
 
 		 562 aa  125  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4380  rare lipoprotein A  45.07 
 
 		 254 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  33.62 
 
 		 608 aa  120  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  36.96 
 
 		 2305 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  36.52 
 
 		 542 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1140  rare lipoprotein A  34.22 
 
 		 273 aa  107  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000289484  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  37.5 
 
 		 2310 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4960  Rare lipoprotein A  36.9 
 
 		 337 aa  97.8  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.317885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4611  Rare lipoprotein A  36.91 
 
 		 251 aa  92.8  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.650181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0861  glycoside hydrolase family 5  32.97 
 
 		 642 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.025002 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 		 526 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3396  rare lipoprotein A  32.95 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160784 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07735  extracellular cellulase CelA/allergen Asp F7-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08030)  31.85 
 
 		 366 aa  76.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 		 660 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  31.35 
 
 		 632 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  22.11 
 
 		 1414 aa  69.3  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  23.74 
 
 		 597 aa  67  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  25.91 
 
 		 633 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  24.38 
 
 		 619 aa  66.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  25.65 
 
 		 649 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  25.12 
 
 		 580 aa  58.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  21.89 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  24.17 
 
 		 658 aa  55.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  21.03 
 
 		 563 aa  51.2  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  21.45 
 
 		 725 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00400  B2-aldehyde-forming enzyme, putative  36.27 
 
 		 359 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  21.68 
 
 		 534 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  22.27 
 
 		 468 aa  44.3  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  22.18 
 
 		 566 aa  43.9  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>