More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3505 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  76.78 
 
 		 2310 aa  3372    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  100 
 
 		 2305 aa  4581    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  51.09 
 
 		 562 aa  385  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  51.54 
 
 		 608 aa  374  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  44.51 
 
 		 542 aa  292  5.0000000000000004e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  40.88 
 
 		 480 aa  258  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.68 
 
 		 2194 aa  254  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  43.37 
 
 		 496 aa  251  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  36.58 
 
 		 660 aa  248  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  36.75 
 
 		 619 aa  235  8.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  36.39 
 
 		 658 aa  234  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  36.03 
 
 		 633 aa  230  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  38.25 
 
 		 614 aa  227  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  37.11 
 
 		 597 aa  226  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  34.97 
 
 		 649 aa  226  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.25 
 
 		 1340 aa  223  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  36.39 
 
 		 580 aa  222  6e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  34.86 
 
 		 526 aa  219  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.02 
 
 		 1225 aa  216  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  33.42 
 
 		 1414 aa  216  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  43.17 
 
 		 539 aa  214  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  52.34 
 
 		 1037 aa  213  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.77 
 
 		 1222 aa  210  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  45.61 
 
 		 507 aa  206  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  42.49 
 
 		 562 aa  199  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  39.51 
 
 		 897 aa  199  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  39.51 
 
 		 897 aa  199  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  39.51 
 
 		 897 aa  199  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  33.02 
 
 		 566 aa  198  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  38.91 
 
 		 686 aa  197  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  38.91 
 
 		 686 aa  197  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  31.63 
 
 		 440 aa  194  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  30.97 
 
 		 440 aa  194  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.41 
 
 		 1009 aa  192  9e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  39.94 
 
 		 504 aa  191  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.35 
 
 		 891 aa  191  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  38.73 
 
 		 1194 aa  191  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  32.85 
 
 		 468 aa  190  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.46 
 
 		 928 aa  189  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  40.31 
 
 		 453 aa  189  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  40.31 
 
 		 453 aa  189  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  40.31 
 
 		 453 aa  188  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  40.31 
 
 		 453 aa  189  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  40.31 
 
 		 449 aa  189  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  40.31 
 
 		 453 aa  189  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  40.31 
 
 		 453 aa  189  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  39.44 
 
 		 451 aa  188  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  31.89 
 
 		 534 aa  187  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  39.75 
 
 		 451 aa  182  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  38.51 
 
 		 451 aa  181  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  39.75 
 
 		 451 aa  180  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  39.75 
 
 		 451 aa  180  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  38.2 
 
 		 451 aa  180  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  38.17 
 
 		 401 aa  179  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  36.66 
 
 		 593 aa  178  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  36.01 
 
 		 665 aa  175  7.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.63 
 
 		 1118 aa  171  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  32.92 
 
 		 539 aa  171  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  35.4 
 
 		 751 aa  171  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  34.19 
 
 		 563 aa  171  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  38.61 
 
 		 481 aa  169  6.9999999999999995e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.3 
 
 		 1113 aa  169  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.15 
 
 		 1012 aa  168  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.63 
 
 		 889 aa  167  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  41.37 
 
 		 1080 aa  164  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  36.81 
 
 		 324 aa  160  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.7 
 
 		 1661 aa  160  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  35.13 
 
 		 324 aa  159  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.24 
 
 		 768 aa  157  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  35.47 
 
 		 358 aa  157  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.85 
 
 		 1800 aa  156  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  40.36 
 
 		 426 aa  155  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  35.51 
 
 		 393 aa  150  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  34.15 
 
 		 537 aa  149  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  35.17 
 
 		 540 aa  146  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  32.06 
 
 		 623 aa  142  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  36.97 
 
 		 315 aa  142  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.94 
 
 		 1269 aa  137  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.43 
 
 		 1269 aa  135  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  27.92 
 
 		 1029 aa  129  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  33.33 
 
 		 543 aa  129  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.76 
 
 		 1029 aa  128  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  34.53 
 
 		 452 aa  127  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  29.09 
 
 		 597 aa  125  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  37.5 
 
 		 584 aa  122  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  31.91 
 
 		 526 aa  120  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  40.62 
 
 		 5899 aa  118  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  36.96 
 
 		 584 aa  117  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  31.32 
 
 		 465 aa  115  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  29.12 
 
 		 548 aa  113  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0861  glycoside hydrolase family 5  26.97 
 
 		 642 aa  109  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.025002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  27.87 
 
 		 552 aa  108  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.4 
 
 		 3168 aa  108  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.42 
 
 		 1180 aa  108  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  28.71 
 
 		 492 aa  105  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  30.91 
 
 		 591 aa  105  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  28.52 
 
 		 461 aa  104  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  27.42 
 
 		 514 aa  103  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  28.12 
 
 		 632 aa  103  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  26.37 
 
 		 338 aa  100  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>