142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0879 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 751 aa  1485    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  41.5 
 
 		 539 aa  198  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  36.22 
 
 		 562 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  36.04 
 
 		 623 aa  174  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  36.75 
 
 		 1194 aa  172  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  35.4 
 
 		 2305 aa  171  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  38.78 
 
 		 504 aa  167  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  37.62 
 
 		 401 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  37.5 
 
 		 451 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  39.66 
 
 		 453 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  39.66 
 
 		 453 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  39.66 
 
 		 453 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  39.66 
 
 		 453 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  39.66 
 
 		 453 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  39.66 
 
 		 449 aa  157  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  39.66 
 
 		 453 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  36.59 
 
 		 451 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  38.11 
 
 		 426 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  34 
 
 		 481 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  34.95 
 
 		 2310 aa  154  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  36.28 
 
 		 451 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  36.28 
 
 		 451 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  37.38 
 
 		 507 aa  150  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  37.54 
 
 		 358 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  37.46 
 
 		 451 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  33.1 
 
 		 593 aa  149  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  37.11 
 
 		 451 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  30.71 
 
 		 492 aa  147  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  32.76 
 
 		 665 aa  147  9e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  33.76 
 
 		 537 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  33.01 
 
 		 324 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  33.98 
 
 		 324 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  39.58 
 
 		 315 aa  137  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  29.58 
 
 		 552 aa  137  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  36.21 
 
 		 490 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  34.71 
 
 		 393 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  37.13 
 
 		 452 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  28.16 
 
 		 686 aa  130  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  27.72 
 
 		 897 aa  130  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  28.16 
 
 		 686 aa  130  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  35.23 
 
 		 526 aa  131  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  27.72 
 
 		 897 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  27.72 
 
 		 897 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  33.99 
 
 		 597 aa  125  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  26.58 
 
 		 514 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  34.46 
 
 		 540 aa  118  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  33.33 
 
 		 324 aa  117  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  26.46 
 
 		 561 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  27.19 
 
 		 521 aa  115  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  32.9 
 
 		 465 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  31.11 
 
 		 421 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  29.83 
 
 		 338 aa  101  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  27.4 
 
 		 548 aa  100  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  28.62 
 
 		 591 aa  90.9  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  26.41 
 
 		 461 aa  90.9  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  29.97 
 
 		 543 aa  90.1  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2747  cellulose-binding domain-containing protein  31.3 
 
 		 671 aa  83.2  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2281  hypothetical protein  32.26 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.120697  normal  0.125889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3717  Carbohydrate-binding family V/XII  29.69 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.0379459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6755  hypothetical protein  28.84 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  35.04 
 
 		 703 aa  64.3  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  42.86 
 
 		 1154 aa  62.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6728  glycosyl hydrolase family chitinase  28.88 
 
 		 365 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  44.74 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  38.05 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  34.85 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.04 
 
 		 809 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  44.94 
 
 		 1121 aa  59.7  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  43.96 
 
 		 655 aa  58.5  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  45.35 
 
 		 2170 aa  58.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  37.93 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381426  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.22 
 
 		 6885 aa  58.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  34.4 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  33.73 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  50.67 
 
 		 649 aa  58.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  41.05 
 
 		 743 aa  57.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  31.18 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  42.16 
 
 		 1004 aa  57  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  44.09 
 
 		 900 aa  57.4  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  43.82 
 
 		 1209 aa  56.2  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  25.75 
 
 		 648 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  43.82 
 
 		 1137 aa  55.8  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  36.62 
 
 		 762 aa  55.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  42.06 
 
 		 651 aa  55.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  41.24 
 
 		 880 aa  54.7  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  34.4 
 
 		 455 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  28.44 
 
 		 455 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  28.44 
 
 		 455 aa  54.3  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  32.8 
 
 		 455 aa  53.9  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  32.8 
 
 		 455 aa  53.9  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  33.6 
 
 		 455 aa  53.9  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  29.67 
 
 		 456 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.37 
 
 		 998 aa  53.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  41.57 
 
 		 667 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  41.25 
 
 		 973 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  40.86 
 
 		 703 aa  52  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  32.58 
 
 		 455 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  27.49 
 
 		 455 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  31.61 
 
 		 465 aa  51.6  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  33.33 
 
 		 1135 aa  51.2  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>