137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2387 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  60.77 
 
 
1221 aa  645    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
703 aa  1423    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  42.72 
 
 
651 aa  462  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  41.44 
 
 
768 aa  382  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  70.27 
 
 
1004 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  43.4 
 
 
481 aa  334  3e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  65.07 
 
 
984 aa  308  3e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  68.09 
 
 
748 aa  306  9.000000000000001e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  57.69 
 
 
1050 aa  277  5e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2389  hypothetical protein  74.66 
 
 
507 aa  225  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.573673  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  29.84 
 
 
626 aa  200  7.999999999999999e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  32.51 
 
 
717 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2400  hypothetical protein  49.31 
 
 
611 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.150385  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  61.22 
 
 
831 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  29.91 
 
 
358 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  26.17 
 
 
365 aa  89.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  27.89 
 
 
1302 aa  80.5  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  30.73 
 
 
346 aa  80.1  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  31.13 
 
 
457 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  24.61 
 
 
566 aa  78.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  29.67 
 
 
451 aa  79  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  28.17 
 
 
1167 aa  78.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  24.39 
 
 
755 aa  77.4  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  27.59 
 
 
426 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  26.51 
 
 
709 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  24.55 
 
 
748 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  30.6 
 
 
638 aa  71.6  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  28.31 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  26.07 
 
 
505 aa  70.1  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  25.08 
 
 
930 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  27.49 
 
 
630 aa  66.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  45.92 
 
 
655 aa  65.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  43 
 
 
614 aa  64.7  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  25.45 
 
 
466 aa  63.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  44.21 
 
 
880 aa  62.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  30.29 
 
 
610 aa  63.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  45.63 
 
 
1154 aa  63.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  44.12 
 
 
900 aa  61.6  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  42.45 
 
 
703 aa  61.2  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  24.5 
 
 
505 aa  60.5  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  26.79 
 
 
426 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  23.84 
 
 
1194 aa  60.1  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.32 
 
 
795 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  22.98 
 
 
322 aa  58.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  41.18 
 
 
552 aa  58.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.11 
 
 
998 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  31.62 
 
 
455 aa  55.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  31.62 
 
 
455 aa  55.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  38.32 
 
 
1238 aa  55.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 
462 aa  55.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  37.25 
 
 
617 aa  55.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  45.12 
 
 
544 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  36.84 
 
 
743 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  31.62 
 
 
455 aa  55.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  42.68 
 
 
649 aa  55.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  37.5 
 
 
787 aa  55.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
455 aa  54.7  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  38.61 
 
 
2170 aa  54.7  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  45.24 
 
 
1121 aa  54.3  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  36.46 
 
 
674 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  33.64 
 
 
455 aa  53.5  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  35.24 
 
 
674 aa  53.5  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  37.74 
 
 
456 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  31.88 
 
 
455 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  31.88 
 
 
455 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  36.46 
 
 
674 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  31.88 
 
 
455 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  22.08 
 
 
459 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  36.05 
 
 
1887 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  36.36 
 
 
749 aa  53.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  36.36 
 
 
458 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  32.61 
 
 
455 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  33.64 
 
 
455 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  40.7 
 
 
2286 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  36.36 
 
 
660 aa  52.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  32.98 
 
 
674 aa  52  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  35.71 
 
 
455 aa  52  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  38.14 
 
 
465 aa  52  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  32.29 
 
 
674 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  32.18 
 
 
948 aa  51.6  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  37.11 
 
 
464 aa  51.6  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  40 
 
 
729 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  32.61 
 
 
456 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  45.24 
 
 
458 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  43.33 
 
 
1137 aa  50.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  35.24 
 
 
514 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  25.32 
 
 
705 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1236  fibronectin, type III  34.69 
 
 
235 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  36.73 
 
 
459 aa  49.3  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  41.18 
 
 
1200 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.76 
 
 
809 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  23.95 
 
 
2305 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  37.93 
 
 
667 aa  49.3  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  31.25 
 
 
674 aa  48.5  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  31.25 
 
 
674 aa  48.5  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  31.25 
 
 
674 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  31.25 
 
 
674 aa  48.5  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  43.33 
 
 
1209 aa  48.5  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  39.67 
 
 
727 aa  48.9  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  41.67 
 
 
973 aa  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>