258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2924 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  100 
 
 		 521 aa  1035    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  52.84 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  38.52 
 
 		 623 aa  289  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  39.35 
 
 		 634 aa  226  8e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  36.08 
 
 		 563 aa  184  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  41.06 
 
 		 816 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  41.83 
 
 		 1057 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  36.14 
 
 		 657 aa  152  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  33.23 
 
 		 481 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  27.19 
 
 		 751 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  34.13 
 
 		 315 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  29.38 
 
 		 593 aa  100  7e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  25.11 
 
 		 897 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  25.11 
 
 		 686 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  25.11 
 
 		 897 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  25.11 
 
 		 686 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  25.11 
 
 		 897 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  28.92 
 
 		 2305 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  28.44 
 
 		 665 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  29.55 
 
 		 1194 aa  95.9  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  57.78 
 
 		 639 aa  95.5  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  29.28 
 
 		 507 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  28.51 
 
 		 324 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2390  Carbohydrate-binding family V/XII  38.99 
 
 		 523 aa  92.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.254143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  30.74 
 
 		 490 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  31.82 
 
 		 465 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.88 
 
 		 669 aa  90.9  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  27.69 
 
 		 324 aa  90.1  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  46.55 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  28.76 
 
 		 597 aa  86.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  52.38 
 
 		 884 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  27.76 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  26.11 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  29.41 
 
 		 539 aa  77.8  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  32.96 
 
 		 792 aa  77.4  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  50 
 
 		 712 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  53.66 
 
 		 2066 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  27.53 
 
 		 2310 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  29.28 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  26.82 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  26.82 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  26.82 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  26.82 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  26.15 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  26.82 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  26.82 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  25.11 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  24.58 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  24.67 
 
 		 451 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  51.22 
 
 		 1050 aa  72.4  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  25.32 
 
 		 562 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  27.62 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  40.65 
 
 		 1150 aa  70.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  38.58 
 
 		 675 aa  70.1  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  26.64 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  48.65 
 
 		 971 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.83 
 
 		 699 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  23.65 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  23.65 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  42.71 
 
 		 971 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  51.47 
 
 		 780 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  35 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.75 
 
 		 892 aa  67.4  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  25.44 
 
 		 401 aa  67  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.68 
 
 		 953 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  33.61 
 
 		 1577 aa  67  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  47.3 
 
 		 1018 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  38.54 
 
 		 1601 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  45.95 
 
 		 971 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  45.95 
 
 		 971 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  45.95 
 
 		 971 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  45.95 
 
 		 971 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  45.95 
 
 		 971 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  34.75 
 
 		 1143 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  45.95 
 
 		 971 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  34.82 
 
 		 814 aa  64.7  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  22.99 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  27.01 
 
 		 548 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  44.59 
 
 		 971 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  55.38 
 
 		 944 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  34.59 
 
 		 960 aa  63.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  34.59 
 
 		 960 aa  63.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  41.67 
 
 		 677 aa  63.5  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  25.94 
 
 		 358 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  45.24 
 
 		 1916 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  26.29 
 
 		 552 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  53.85 
 
 		 944 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  53.85 
 
 		 944 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.86 
 
 		 6885 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  53.85 
 
 		 944 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  34.96 
 
 		 967 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  30.83 
 
 		 985 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  24.86 
 
 		 561 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  36.07 
 
 		 1135 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  35 
 
 		 1104 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  31.25 
 
 		 868 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  31.25 
 
 		 868 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  45.45 
 
 		 1565 aa  62  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  37.12 
 
 		 778 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  37.12 
 
 		 778 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>