60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2142 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  97.22 
 
 
324 aa  663    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  676    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  42.12 
 
 
593 aa  235  9e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  41.12 
 
 
665 aa  235  9e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  37.38 
 
 
507 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  36.51 
 
 
539 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  39.72 
 
 
1194 aa  161  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  36.81 
 
 
2305 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  34.01 
 
 
451 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  34.58 
 
 
451 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  34.58 
 
 
451 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  33.81 
 
 
504 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  33.33 
 
 
401 aa  149  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  34.88 
 
 
451 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  33.72 
 
 
451 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  33.72 
 
 
451 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  33.98 
 
 
751 aa  143  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  34.37 
 
 
453 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  34.37 
 
 
453 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  34.37 
 
 
453 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  34.37 
 
 
453 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  34.37 
 
 
453 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  34.37 
 
 
453 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  34.37 
 
 
449 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  34.59 
 
 
2310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  33.92 
 
 
562 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  31.87 
 
 
897 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  31.87 
 
 
897 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  30.23 
 
 
481 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  31.87 
 
 
897 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  31.56 
 
 
686 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  31.56 
 
 
686 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  32.9 
 
 
358 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2747  cellulose-binding domain-containing protein  30.82 
 
 
671 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  30.58 
 
 
623 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  32.37 
 
 
426 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  27.76 
 
 
540 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  35.42 
 
 
315 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  30.67 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6728  glycosyl hydrolase family chitinase  28.71 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749881  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3717  Carbohydrate-binding family V/XII  30.25 
 
 
436 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.0379459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  31.35 
 
 
537 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  31.33 
 
 
490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  30.88 
 
 
526 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  27.5 
 
 
338 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  30.07 
 
 
543 aa  98.6  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  27.14 
 
 
552 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  30.79 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  27.68 
 
 
597 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  27.66 
 
 
561 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  26.43 
 
 
492 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  28.51 
 
 
521 aa  92.8  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  27.88 
 
 
514 aa  89.7  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  30.21 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  25.09 
 
 
548 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  26.8 
 
 
421 aa  82.4  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  31.89 
 
 
465 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  28.79 
 
 
591 aa  79.7  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  24.43 
 
 
461 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6755  hypothetical protein  23.69 
 
 
358 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.319282 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>