More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02880 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  100 
 
 		 1916 aa  3773    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  42.35 
 
 		 1150 aa  576  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  42.53 
 
 		 1565 aa  557  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  39.08 
 
 		 2066 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  34.57 
 
 		 1009 aa  327  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  42.79 
 
 		 734 aa  140  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  30.45 
 
 		 1057 aa  137  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  49.12 
 
 		 816 aa  135  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  31.51 
 
 		 3197 aa  127  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  30.63 
 
 		 3197 aa  127  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  44.51 
 
 		 623 aa  122  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  29.61 
 
 		 2176 aa  111  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  37.71 
 
 		 873 aa  110  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0663  peptidase S26B, signal peptidase  42.17 
 
 		 618 aa  107  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.10738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1014  metallophosphoesterase  37.2 
 
 		 890 aa  104  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0724249 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  33.86 
 
 		 552 aa  103  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0628  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  38.27 
 
 		 574 aa  102  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  29.43 
 
 		 675 aa  102  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  31.84 
 
 		 1667 aa  99.8  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  38.56 
 
 		 517 aa  99.8  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  31.91 
 
 		 735 aa  99.4  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  35.96 
 
 		 1027 aa  97.8  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  32.3 
 
 		 658 aa  97.8  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  32.87 
 
 		 581 aa  97.8  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  30.28 
 
 		 3295 aa  97.1  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  30.94 
 
 		 752 aa  97.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2117  glycosyl hydrolase family 88  36.28 
 
 		 623 aa  97.1  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  30.87 
 
 		 713 aa  96.7  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1682 aa  95.5  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  46.15 
 
 		 775 aa  95.1  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  35 
 
 		 792 aa  95.1  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  32.89 
 
 		 943 aa  95.1  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  29.33 
 
 		 1969 aa  93.2  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  41.88 
 
 		 935 aa  92.8  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  29.91 
 
 		 1094 aa  92.8  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  30.55 
 
 		 1120 aa  92.8  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  31.4 
 
 		 1602 aa  92.4  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  31 
 
 		 679 aa  92  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  31.3 
 
 		 669 aa  92  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  29.02 
 
 		 1300 aa  91.3  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  28.87 
 
 		 2036 aa  90.5  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1667 aa  90.5  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  32.24 
 
 		 1620 aa  90.5  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  29.27 
 
 		 1371 aa  90.1  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  30.12 
 
 		 1356 aa  89.7  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  25.22 
 
 		 859 aa  89.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  31.03 
 
 		 2122 aa  89.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  31.7 
 
 		 910 aa  89.4  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  23.72 
 
 		 561 aa  89.4  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  34.96 
 
 		 528 aa  88.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  30.7 
 
 		 1882 aa  87.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1823  hypothetical protein  30.32 
 
 		 646 aa  87.8  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  26.81 
 
 		 1814 aa  87.4  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  27.88 
 
 		 791 aa  86.7  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  28.36 
 
 		 1862 aa  87  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  32.86 
 
 		 998 aa  87  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  29.96 
 
 		 685 aa  86.7  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  27.27 
 
 		 2272 aa  86.7  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  30.89 
 
 		 861 aa  86.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  42.34 
 
 		 938 aa  86.3  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  29.58 
 
 		 575 aa  85.9  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  30.27 
 
 		 1732 aa  85.9  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  29.19 
 
 		 615 aa  85.9  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  36.36 
 
 		 951 aa  85.1  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  28.14 
 
 		 1361 aa  85.5  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  27.03 
 
 		 1528 aa  84.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.76 
 
 		 940 aa  84.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  28.57 
 
 		 551 aa  84.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.5 
 
 		 773 aa  84.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1832  hypothetical protein  29.15 
 
 		 661 aa  84  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0514384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  31.43 
 
 		 2000 aa  83.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  55.7 
 
 		 780 aa  83.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  27.68 
 
 		 978 aa  83.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  36.65 
 
 		 936 aa  83.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  29.92 
 
 		 1842 aa  83.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  36.65 
 
 		 936 aa  83.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  30.62 
 
 		 963 aa  83.2  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  32.55 
 
 		 1606 aa  82.4  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  25.3 
 
 		 547 aa  81.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  24.78 
 
 		 952 aa  81.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  53.66 
 
 		 712 aa  81.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  28.38 
 
 		 929 aa  81.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  54.79 
 
 		 778 aa  80.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  54.79 
 
 		 778 aa  80.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  54.79 
 
 		 778 aa  80.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  54.79 
 
 		 778 aa  80.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.41 
 
 		 945 aa  80.1  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  30.09 
 
 		 1987 aa  80.1  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  32.95 
 
 		 918 aa  79.7  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  52 
 
 		 777 aa  79.7  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5022  hypothetical protein  28.07 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  39.38 
 
 		 917 aa  79.7  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  60.27 
 
 		 823 aa  79.3  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  28.22 
 
 		 1241 aa  79  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  36.6 
 
 		 948 aa  78.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  48.81 
 
 		 713 aa  78.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  30.99 
 
 		 786 aa  78.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  26.89 
 
 		 1162 aa  78.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  51.95 
 
 		 944 aa  77.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  29.17 
 
 		 958 aa  77.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>