147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2619 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  75.67 
 
 		 991 aa  1552    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 998 aa  2015    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  39.34 
 
 		 1512 aa  346  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1416 aa  338  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  33.96 
 
 		 2001 aa  114  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  39.53 
 
 		 3197 aa  105  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.07 
 
 		 3363 aa  101  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  34.29 
 
 		 2169 aa  101  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.86 
 
 		 994 aa  98.2  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  40.91 
 
 		 1055 aa  96.3  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  37.56 
 
 		 16311 aa  95.1  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  39.71 
 
 		 3197 aa  94.7  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  27.1 
 
 		 4978 aa  91.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  38.6 
 
 		 2567 aa  90.1  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  39.82 
 
 		 2060 aa  89  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  36.9 
 
 		 2145 aa  88.2  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.91 
 
 		 2678 aa  87.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  32.33 
 
 		 1916 aa  87  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.36 
 
 		 11716 aa  83.2  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.05 
 
 		 850 aa  81.3  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  36.96 
 
 		 5769 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  29.24 
 
 		 6276 aa  80.9  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  35.09 
 
 		 2132 aa  80.5  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  25.93 
 
 		 2074 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  27.87 
 
 		 3927 aa  75.5  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  27.39 
 
 		 4848 aa  74.7  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  27.15 
 
 		 5745 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  25.88 
 
 		 892 aa  73.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.25 
 
 		 2507 aa  72  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  31 
 
 		 2461 aa  71.6  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  27.49 
 
 		 3474 aa  71.6  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.13 
 
 		 1884 aa  71.6  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  30.04 
 
 		 4231 aa  70.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  30.9 
 
 		 1565 aa  69.3  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  28.42 
 
 		 2153 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  28.71 
 
 		 1706 aa  68.2  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  31.46 
 
 		 2127 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  33.88 
 
 		 3132 aa  66.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  31.82 
 
 		 2555 aa  64.3  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.57 
 
 		 761 aa  64.3  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  40.22 
 
 		 715 aa  62.4  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  24.72 
 
 		 1597 aa  61.6  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  30.82 
 
 		 2816 aa  61.6  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  24.15 
 
 		 1268 aa  61.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  30.91 
 
 		 2522 aa  60.1  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  30.67 
 
 		 734 aa  60.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  35.9 
 
 		 3544 aa  60.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  25.28 
 
 		 721 aa  59.7  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  23.31 
 
 		 1269 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  24.29 
 
 		 873 aa  58.9  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  27.07 
 
 		 735 aa  58.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  26.92 
 
 		 7284 aa  57.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  30.72 
 
 		 792 aa  57.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  31.98 
 
 		 1150 aa  57.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  24.66 
 
 		 814 aa  57.4  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  30.32 
 
 		 3699 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  27.63 
 
 		 679 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  26.26 
 
 		 2767 aa  56.6  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  29.84 
 
 		 1027 aa  57  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  29.86 
 
 		 2503 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2477  PKD domain containing protein  24.91 
 
 		 393 aa  56.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.041582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.86 
 
 		 3699 aa  55.8  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  32.72 
 
 		 816 aa  54.7  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  36.84 
 
 		 2476 aa  54.7  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  27.31 
 
 		 581 aa  54.3  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  27.91 
 
 		 1152 aa  54.3  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1750 aa  54.3  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1682 aa  53.5  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  35.51 
 
 		 3089 aa  53.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  23.81 
 
 		 1269 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  26.69 
 
 		 675 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  26.45 
 
 		 4854 aa  52.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  26.03 
 
 		 547 aa  52.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  28.41 
 
 		 1867 aa  52.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  24.67 
 
 		 1096 aa  52.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  35.37 
 
 		 1141 aa  52.4  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  30.06 
 
 		 1057 aa  52.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  28.05 
 
 		 658 aa  52.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  25.32 
 
 		 2272 aa  52  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  26.39 
 
 		 2036 aa  52  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  30.7 
 
 		 517 aa  52.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  34.97 
 
 		 2066 aa  51.6  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  36.89 
 
 		 2839 aa  51.6  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  25 
 
 		 561 aa  51.2  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1699 aa  51.2  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  28.1 
 
 		 1094 aa  51.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  26.03 
 
 		 1300 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  26.35 
 
 		 1842 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  24.68 
 
 		 978 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  27.84 
 
 		 941 aa  50.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  25.78 
 
 		 16322 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  28.16 
 
 		 685 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  34.33 
 
 		 2542 aa  50.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  24.41 
 
 		 2122 aa  50.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  29.08 
 
 		 963 aa  50.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.64 
 
 		 2114 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  26.94 
 
 		 2176 aa  49.3  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  27.12 
 
 		 1120 aa  48.9  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  32.09 
 
 		 623 aa  49.3  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  34.62 
 
 		 936 aa  49.3  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>