105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2477 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2477  PKD domain containing protein  100 
 
 		 393 aa  786    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.041582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  31.72 
 
 		 1565 aa  83.2  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  28.96 
 
 		 963 aa  73.6  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  30.1 
 
 		 734 aa  73.2  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  23.58 
 
 		 2656 aa  72.8  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  27.51 
 
 		 2272 aa  70.1  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  28.3 
 
 		 2000 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  29.43 
 
 		 1779 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  28.02 
 
 		 1094 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  27.43 
 
 		 1120 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1916 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  28.61 
 
 		 679 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  28.73 
 
 		 669 aa  66.2  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1682 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  37.38 
 
 		 1150 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  27.63 
 
 		 2122 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  26.76 
 
 		 1969 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  26.92 
 
 		 2169 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1001 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  26.11 
 
 		 1842 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  30.62 
 
 		 675 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  29.09 
 
 		 1300 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  28.38 
 
 		 859 aa  59.7  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  29.02 
 
 		 8321 aa  59.7  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  27.58 
 
 		 528 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  28.11 
 
 		 978 aa  59.7  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  27.4 
 
 		 1241 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  27.41 
 
 		 1882 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  30.24 
 
 		 1667 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  28.22 
 
 		 791 aa  57.4  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  26.63 
 
 		 575 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  31.52 
 
 		 2066 aa  57  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  27.75 
 
 		 561 aa  56.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  28.42 
 
 		 2036 aa  56.2  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  24.73 
 
 		 861 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2619  PKD domain-containing protein  25 
 
 		 998 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  27.9 
 
 		 685 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  28.34 
 
 		 658 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  29.3 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  26.63 
 
 		 930 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  26.69 
 
 		 1387 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  30.42 
 
 		 752 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.06 
 
 		 1505 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  27.67 
 
 		 1528 aa  54.3  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  31.88 
 
 		 1027 aa  53.9  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.65 
 
 		 3197 aa  53.5  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  27.65 
 
 		 929 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  25.08 
 
 		 941 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0815  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1124 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.676426  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  35.51 
 
 		 938 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  34.23 
 
 		 869 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  31.37 
 
 		 1328 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  25.75 
 
 		 1862 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.19 
 
 		 2507 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0022  fibronectin type III domain-containing protein  24.56 
 
 		 730 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0168573  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  30.52 
 
 		 938 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  28.26 
 
 		 960 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  27.47 
 
 		 2636 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1667 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  34.44 
 
 		 1095 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  27.7 
 
 		 581 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  26.62 
 
 		 991 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  26.54 
 
 		 1371 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  28.11 
 
 		 935 aa  49.7  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  28.33 
 
 		 634 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  26.3 
 
 		 1531 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  29.36 
 
 		 547 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  32.16 
 
 		 623 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  26.47 
 
 		 792 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.78 
 
 		 3699 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  26.22 
 
 		 6276 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  57.89 
 
 		 682 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  28.47 
 
 		 1602 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  28.81 
 
 		 1292 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  28.69 
 
 		 1356 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  26.32 
 
 		 918 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  31.19 
 
 		 551 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  27.4 
 
 		 936 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  28.86 
 
 		 3699 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  25.41 
 
 		 635 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  27.4 
 
 		 936 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  27.6 
 
 		 552 aa  47  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0510  hypothetical protein  29.85 
 
 		 451 aa  46.6  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.644592 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  31.85 
 
 		 873 aa  46.2  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  27.56 
 
 		 615 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  25.63 
 
 		 1422 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  26.84 
 
 		 1597 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  28.28 
 
 		 3197 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  25.39 
 
 		 958 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  27.96 
 
 		 930 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  29.31 
 
 		 2377 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  30.18 
 
 		 816 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  31.98 
 
 		 1236 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  24.93 
 
 		 2554 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0140  PKD domain containing protein  24.57 
 
 		 1362 aa  44.3  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.79 
 
 		 1092 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  26.95 
 
 		 910 aa  43.5  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  28.62 
 
 		 1011 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.43 
 
 		 773 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  25.66 
 
 		 3295 aa  43.5  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>