200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0510 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0510  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  842    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.644592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  47.77 
 
 
528 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  47.83 
 
 
460 aa  110  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  46.11 
 
 
1732 aa  110  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  41.23 
 
 
2272 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  43.83 
 
 
940 aa  106  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  36.1 
 
 
1120 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  30.92 
 
 
861 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  35 
 
 
575 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  35.62 
 
 
1231 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  41.32 
 
 
963 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  43.48 
 
 
2554 aa  104  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  40.85 
 
 
1094 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  41.54 
 
 
1842 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  29.92 
 
 
2000 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  41.57 
 
 
561 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  39.69 
 
 
1682 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  41.14 
 
 
2036 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  45.62 
 
 
3295 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  40.93 
 
 
910 aa  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  39.91 
 
 
1356 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  38.31 
 
 
1882 aa  99.8  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  44.38 
 
 
752 aa  99.8  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  43.75 
 
 
713 aa  99.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  35.12 
 
 
581 aa  99.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  33.7 
 
 
1282 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  36.73 
 
 
1667 aa  99.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  42.95 
 
 
184 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  41.14 
 
 
1300 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  43.83 
 
 
1969 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  37.28 
 
 
930 aa  98.6  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  33.09 
 
 
679 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  40.56 
 
 
2122 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  34.96 
 
 
675 aa  97.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  44 
 
 
791 aa  97.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  37.97 
 
 
1361 aa  97.1  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  34.45 
 
 
1328 aa  96.3  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  35.66 
 
 
735 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  34.15 
 
 
669 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  38.1 
 
 
859 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  44.23 
 
 
547 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  42.95 
 
 
1241 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  38.28 
 
 
978 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  43.53 
 
 
1236 aa  94  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  41.4 
 
 
644 aa  93.6  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  40.49 
 
 
615 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  36.49 
 
 
816 aa  93.2  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  31.1 
 
 
1862 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  32.61 
 
 
658 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  34.23 
 
 
941 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  41.44 
 
 
519 aa  91.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  37.82 
 
 
530 aa  90.1  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  34.89 
 
 
685 aa  90.1  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  41.88 
 
 
560 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  41.03 
 
 
551 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  34.31 
 
 
1095 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  41.92 
 
 
1531 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  37.5 
 
 
1387 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  38.31 
 
 
838 aa  87.4  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  38.95 
 
 
996 aa  87.4  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  40.28 
 
 
971 aa  87  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  34.44 
 
 
1528 aa  86.7  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  38.51 
 
 
500 aa  86.7  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  36.31 
 
 
1931 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  34.35 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  39.35 
 
 
823 aa  84  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  36.72 
 
 
408 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  39.04 
 
 
958 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  34.2 
 
 
1380 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  38.93 
 
 
2552 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  33.87 
 
 
400 aa  79.7  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  39.66 
 
 
1667 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  32.62 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  34.04 
 
 
960 aa  77  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  31.05 
 
 
525 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  34.34 
 
 
848 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  37.2 
 
 
1001 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  34 
 
 
819 aa  74.7  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  38.1 
 
 
869 aa  74.3  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  28.73 
 
 
952 aa  73.9  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  31.25 
 
 
1189 aa  73.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  34.04 
 
 
1814 aa  73.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  35.71 
 
 
930 aa  73.2  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  31.39 
 
 
938 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  40.26 
 
 
918 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  34.5 
 
 
771 aa  70.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  30.18 
 
 
2176 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  36.96 
 
 
777 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  35.67 
 
 
586 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  34.39 
 
 
719 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  31.1 
 
 
870 aa  67.8  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1273  PKD repeat-containing protein  36.48 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  57.35 
 
 
561 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  31.6 
 
 
1292 aa  66.6  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1336  PKD domain containing protein  53.73 
 
 
567 aa  66.6  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  33.75 
 
 
786 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  31.2 
 
 
845 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  35 
 
 
802 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  33.16 
 
 
769 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.11 
 
 
625 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.470845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>