More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3429 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  100 
 
 		 1027 aa  2096    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0815  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  32.48 
 
 		 417 aa  229  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2257  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  32.59 
 
 		 390 aa  189  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251039  normal  0.490974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  32.63 
 
 		 1565 aa  127  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  30.65 
 
 		 2062 aa  121  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  36.97 
 
 		 816 aa  111  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  38.8 
 
 		 792 aa  108  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  37.91 
 
 		 623 aa  105  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  38.5 
 
 		 1150 aa  104  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  39.77 
 
 		 1154 aa  102  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  37.85 
 
 		 929 aa  100  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  40.37 
 
 		 1842 aa  99.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  33.01 
 
 		 1916 aa  98.6  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  37.18 
 
 		 1094 aa  96.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  38.61 
 
 		 940 aa  95.9  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  40.67 
 
 		 2176 aa  95.1  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  38.36 
 
 		 944 aa  94.4  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  33.33 
 
 		 658 aa  94  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  38.93 
 
 		 1057 aa  93.2  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  32.7 
 
 		 528 aa  93.2  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.54 
 
 		 940 aa  92.8  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  33.07 
 
 		 861 aa  92.4  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  31.86 
 
 		 3295 aa  92.8  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  45.11 
 
 		 938 aa  93.2  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  37.5 
 
 		 500 aa  92.8  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0300  metallopeptidase, putative  25.33 
 
 		 528 aa  92.4  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292389  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  38.71 
 
 		 944 aa  92  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  39.22 
 
 		 944 aa  92  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  39.22 
 
 		 944 aa  91.7  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  35.58 
 
 		 713 aa  91.7  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  35.85 
 
 		 685 aa  91.3  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  38.17 
 
 		 1732 aa  91.3  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  40.14 
 
 		 443 aa  90.9  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  34.59 
 
 		 713 aa  90.9  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  35.22 
 
 		 679 aa  90.5  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  33.93 
 
 		 1969 aa  90.9  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  40.58 
 
 		 1162 aa  89.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  38.71 
 
 		 735 aa  90.1  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  35.09 
 
 		 675 aa  89.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  34.78 
 
 		 669 aa  90.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  39.63 
 
 		 965 aa  90.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  34.12 
 
 		 1292 aa  90.1  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  32.04 
 
 		 2066 aa  90.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  39.07 
 
 		 948 aa  89.4  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  32.73 
 
 		 918 aa  89.4  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  37.78 
 
 		 938 aa  88.2  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  35.91 
 
 		 1361 aa  88.2  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  37.91 
 
 		 786 aa  87.8  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  34.73 
 
 		 1862 aa  87  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  42.86 
 
 		 951 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  34.31 
 
 		 2554 aa  87  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  33.33 
 
 		 859 aa  86.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  31.92 
 
 		 530 aa  86.3  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  35.33 
 
 		 1814 aa  86.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.18 
 
 		 942 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0320  Ricin B lectin  25.83 
 
 		 565 aa  85.1  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  43.44 
 
 		 870 aa  85.1  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  36 
 
 		 930 aa  84.7  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  27.74 
 
 		 685 aa  84.7  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  30.33 
 
 		 1095 aa  84.7  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  34.15 
 
 		 586 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  35.8 
 
 		 1311 aa  84.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  30.9 
 
 		 838 aa  84  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  29.92 
 
 		 460 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  40.3 
 
 		 581 aa  83.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  28.86 
 
 		 689 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  40.88 
 
 		 1667 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  32.13 
 
 		 1356 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  35.39 
 
 		 1011 aa  83.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  39.87 
 
 		 948 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  32.72 
 
 		 1389 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  34.04 
 
 		 719 aa  83.2  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  33.73 
 
 		 963 aa  82.8  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  38.35 
 
 		 1987 aa  82.4  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  29.08 
 
 		 561 aa  82.4  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  35.63 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  33.51 
 
 		 2000 aa  82  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  40.91 
 
 		 948 aa  82  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  35.85 
 
 		 734 aa  81.6  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.62 
 
 		 947 aa  81.6  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  29.01 
 
 		 3197 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  46.99 
 
 		 840 aa  81.3  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  40.13 
 
 		 948 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  40 
 
 		 935 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  39.67 
 
 		 845 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.24 
 
 		 944 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  40.98 
 
 		 802 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  33.87 
 
 		 1667 aa  79.7  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  36.42 
 
 		 1236 aa  79.3  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  34.39 
 
 		 1528 aa  79.7  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  35.45 
 
 		 978 aa  79  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  34.43 
 
 		 2272 aa  79  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  36.81 
 
 		 869 aa  78.6  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  33.86 
 
 		 1882 aa  78.2  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  43.75 
 
 		 1151 aa  77.8  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  29.89 
 
 		 3197 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  37.82 
 
 		 823 aa  77.8  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  35.85 
 
 		 547 aa  77.4  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  38.66 
 
 		 840 aa  77.4  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1682 aa  77.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>