44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2053 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  84.35 
 
 		 689 aa  1106    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  100 
 
 		 685 aa  1401    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2081  hypothetical protein  27 
 
 		 560 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2446  hypothetical protein  34.59 
 
 		 599 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0772125  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0815  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  28.46 
 
 		 417 aa  95.9  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28100  hypothetical protein  33.83 
 
 		 602 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2257  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  24.44 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251039  normal  0.490974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4162  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  35.76 
 
 		 596 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  27.62 
 
 		 1027 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  29.46 
 
 		 2062 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1270 aa  60.8  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  42.7 
 
 		 966 aa  58.9  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  39 
 
 		 595 aa  58.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  34.29 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  41.18 
 
 		 763 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  33.77 
 
 		 748 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  30.21 
 
 		 398 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  28.04 
 
 		 492 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  36.17 
 
 		 1162 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  35.56 
 
 		 258 aa  55.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  37.5 
 
 		 479 aa  54.7  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  35.56 
 
 		 990 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1151  hypothetical protein  40 
 
 		 896 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.442679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  38.04 
 
 		 554 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  38.89 
 
 		 562 aa  52  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  33.71 
 
 		 516 aa  51.2  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  36.25 
 
 		 844 aa  51.2  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  34.18 
 
 		 679 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  34.86 
 
 		 287 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  36.71 
 
 		 997 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  39.13 
 
 		 908 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0300  metallopeptidase, putative  23.53 
 
 		 528 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292389  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  31.58 
 
 		 1061 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  29.7 
 
 		 931 aa  48.1  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  37.27 
 
 		 1106 aa  47.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  32.22 
 
 		 695 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.47 
 
 		 1092 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.31 
 
 		 673 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  31.07 
 
 		 676 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  32.95 
 
 		 468 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0143  lipolytic protein G-D-S-L family  27.71 
 
 		 305 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  31.37 
 
 		 668 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4627  hypothetical protein  26.49 
 
 		 608 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.254365  normal  0.63618 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  36.51 
 
 		 998 aa  44.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>