More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2824 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  100 
 
 		 734 aa  1414    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  36.43 
 
 		 1057 aa  224  4.9999999999999996e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  33.33 
 
 		 1094 aa  213  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  33.46 
 
 		 1667 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  33.15 
 
 		 978 aa  206  9e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  30.85 
 
 		 561 aa  204  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  31.72 
 
 		 1682 aa  201  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  41.9 
 
 		 1565 aa  200  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  32.48 
 
 		 752 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  32.22 
 
 		 2272 aa  198  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  32.7 
 
 		 1842 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  30.17 
 
 		 1862 aa  189  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  32.06 
 
 		 1667 aa  187  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  34.23 
 
 		 958 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  29.39 
 
 		 2176 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  31.48 
 
 		 859 aa  184  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  33.48 
 
 		 735 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  31.24 
 
 		 1361 aa  183  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  29.77 
 
 		 941 aa  182  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  29.66 
 
 		 1528 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  30.55 
 
 		 1387 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  55.08 
 
 		 816 aa  172  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  33.26 
 
 		 2000 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  29.92 
 
 		 1606 aa  170  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  46.39 
 
 		 623 aa  170  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1282 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  32.37 
 
 		 2122 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  31.19 
 
 		 1236 aa  168  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  32.03 
 
 		 2036 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  33.79 
 
 		 930 aa  165  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  30.55 
 
 		 963 aa  165  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  32.73 
 
 		 528 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  32.41 
 
 		 575 aa  164  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  28.87 
 
 		 1814 aa  164  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  34.51 
 
 		 675 aa  163  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  33.24 
 
 		 679 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  33.33 
 
 		 669 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  33.87 
 
 		 1356 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  32.26 
 
 		 713 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  42.02 
 
 		 1916 aa  154  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  29.7 
 
 		 1882 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  29.07 
 
 		 658 aa  151  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  32.14 
 
 		 685 aa  150  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  32.46 
 
 		 3197 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  35.76 
 
 		 2554 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  36.31 
 
 		 517 aa  146  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  29.02 
 
 		 952 aa  147  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  31.21 
 
 		 530 aa  145  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  32.16 
 
 		 1300 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  32.09 
 
 		 861 aa  142  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  27.77 
 
 		 1011 aa  142  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  29.1 
 
 		 1771 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  32.59 
 
 		 3197 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  52.69 
 
 		 1150 aa  139  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  32.2 
 
 		 1969 aa  137  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  35 
 
 		 460 aa  137  8e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  29.6 
 
 		 1602 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  32.94 
 
 		 1120 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  37.19 
 
 		 552 aa  137  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  30.74 
 
 		 1389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  32.08 
 
 		 869 aa  135  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  26.21 
 
 		 1620 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  31.38 
 
 		 1241 aa  132  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  30.8 
 
 		 1371 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  28.92 
 
 		 1011 aa  127  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  28.6 
 
 		 1783 aa  127  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  31.56 
 
 		 615 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  29.81 
 
 		 581 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  31.75 
 
 		 551 aa  125  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  32.1 
 
 		 791 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  26.11 
 
 		 865 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  34.05 
 
 		 910 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  28.73 
 
 		 838 aa  120  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  31.95 
 
 		 547 aa  119  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  33.85 
 
 		 792 aa  119  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  28.98 
 
 		 929 aa  114  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  33.89 
 
 		 873 aa  114  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  50 
 
 		 2066 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  29.33 
 
 		 1987 aa  111  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  27.87 
 
 		 1531 aa  111  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  35.05 
 
 		 443 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  28.92 
 
 		 719 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  34.33 
 
 		 3295 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  29.05 
 
 		 870 aa  107  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  31.93 
 
 		 971 aa  107  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  28.61 
 
 		 1292 aa  107  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  27.66 
 
 		 2552 aa  107  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  28.02 
 
 		 802 aa  105  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  27.49 
 
 		 1162 aa  104  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  29.94 
 
 		 823 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  31.88 
 
 		 1230 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  26.36 
 
 		 1466 aa  101  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  34.96 
 
 		 1095 aa  101  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  31 
 
 		 917 aa  98.6  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  28.01 
 
 		 845 aa  99  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  43.07 
 
 		 1027 aa  99  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  30.39 
 
 		 815 aa  98.2  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  30.91 
 
 		 823 aa  95.9  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  33.46 
 
 		 938 aa  95.1  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2477  PKD domain containing protein  31.44 
 
 		 393 aa  95.1  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.041582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>