272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_3026 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 552 aa  1095    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  35.98 
 
 		 734 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  38.49 
 
 		 1565 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  39.17 
 
 		 3197 aa  120  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  37.39 
 
 		 3197 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  35.29 
 
 		 2554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  37.72 
 
 		 528 aa  111  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  32.97 
 
 		 752 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  29.08 
 
 		 861 aa  106  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  34.63 
 
 		 963 aa  104  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  29.35 
 
 		 859 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  31.79 
 
 		 2036 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  33.86 
 
 		 1916 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  31.23 
 
 		 1094 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  36.78 
 
 		 2122 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  34.46 
 
 		 517 aa  101  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  33.48 
 
 		 1667 aa  101  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  31.84 
 
 		 561 aa  100  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  34.78 
 
 		 1732 aa  99.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  31.43 
 
 		 1300 aa  99.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  32.16 
 
 		 1842 aa  99.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  32.54 
 
 		 1528 aa  99.8  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  35.02 
 
 		 3295 aa  98.2  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  32.42 
 
 		 547 aa  97.8  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  32.44 
 
 		 941 aa  97.8  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  33.47 
 
 		 930 aa  97.8  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  30.11 
 
 		 1282 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  42.14 
 
 		 1057 aa  97.8  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  31.2 
 
 		 713 aa  97.1  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  31.25 
 
 		 615 aa  97.1  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  32.53 
 
 		 575 aa  96.7  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  33.86 
 
 		 1361 aa  96.3  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  31.6 
 
 		 1969 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  33.6 
 
 		 978 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  36.48 
 
 		 792 aa  96.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  34.13 
 
 		 910 aa  95.5  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  34.58 
 
 		 2176 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  39.6 
 
 		 623 aa  95.9  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  32.2 
 
 		 679 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  33.33 
 
 		 669 aa  95.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  31.87 
 
 		 1241 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  32.75 
 
 		 530 aa  94.7  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  31.82 
 
 		 791 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  34.22 
 
 		 971 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  33.58 
 
 		 1236 aa  94  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  32.27 
 
 		 1120 aa  93.6  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  37.66 
 
 		 317 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  31.23 
 
 		 675 aa  93.2  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  33.75 
 
 		 1150 aa  93.2  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  32.02 
 
 		 865 aa  92.8  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  33.2 
 
 		 735 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  34.43 
 
 		 685 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  39.33 
 
 		 816 aa  92.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  31.67 
 
 		 1667 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  32.53 
 
 		 2000 aa  91.3  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  31.71 
 
 		 581 aa  90.9  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  32.66 
 
 		 1882 aa  90.9  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  32.55 
 
 		 1682 aa  91.3  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  28.67 
 
 		 1862 aa  91.3  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  30.92 
 
 		 1814 aa  90.5  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  30 
 
 		 551 aa  90.1  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  32.48 
 
 		 460 aa  87.8  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  31.5 
 
 		 2272 aa  87.8  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  30.67 
 
 		 1356 aa  87.4  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  31.77 
 
 		 958 aa  87.4  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  34.22 
 
 		 816 aa  87  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  32.72 
 
 		 823 aa  87  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  32.41 
 
 		 1620 aa  87  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  31.92 
 
 		 658 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  32.6 
 
 		 1602 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  32.09 
 
 		 1095 aa  85.9  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  33.18 
 
 		 786 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  34.25 
 
 		 802 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  31.69 
 
 		 2552 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  31.12 
 
 		 819 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  29.26 
 
 		 838 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  30.8 
 
 		 719 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  32.39 
 
 		 1387 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  39.47 
 
 		 938 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  34.06 
 
 		 1606 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  34.97 
 
 		 2066 aa  82.4  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  28.88 
 
 		 929 aa  82.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  31.25 
 
 		 869 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  32.73 
 
 		 870 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  34.71 
 
 		 845 aa  82  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  33.47 
 
 		 930 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  36.88 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  34.92 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  27.59 
 
 		 1011 aa  79.7  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  29 
 
 		 823 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  31.38 
 
 		 777 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  35.1 
 
 		 873 aa  77.4  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  34.78 
 
 		 644 aa  77  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  28.29 
 
 		 1162 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  40.41 
 
 		 938 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  34.07 
 
 		 1231 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  34.23 
 
 		 1027 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  34.65 
 
 		 1531 aa  74.3  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  26.92 
 
 		 1292 aa  73.9  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  39.87 
 
 		 951 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>