263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2522 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2522  PKD  100 
 
 
865 aa  1798    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  31.87 
 
 
941 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  35.23 
 
 
1094 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  32.51 
 
 
1862 aa  288  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  32.36 
 
 
1667 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  31.35 
 
 
1361 aa  270  8e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  35.24 
 
 
963 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  33.22 
 
 
1682 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  30.48 
 
 
2272 aa  257  6e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  32.53 
 
 
1667 aa  257  7e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  34.83 
 
 
1842 aa  231  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  32.65 
 
 
978 aa  222  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  28.98 
 
 
1282 aa  220  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  27.29 
 
 
1528 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  33.33 
 
 
752 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  31.81 
 
 
561 aa  201  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  34.57 
 
 
1356 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  28.36 
 
 
1387 aa  196  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  34.2 
 
 
735 aa  195  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 
2554 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  33.25 
 
 
528 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  29.05 
 
 
930 aa  185  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  33.41 
 
 
2036 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  30 
 
 
1236 aa  183  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  33.65 
 
 
2000 aa  177  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  36.21 
 
 
658 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  27.46 
 
 
1606 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  33.01 
 
 
1882 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  32.15 
 
 
958 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  26.77 
 
 
1011 aa  174  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  36.24 
 
 
669 aa  173  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  28.17 
 
 
1783 aa  172  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  35.91 
 
 
713 aa  172  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  34.92 
 
 
679 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  34.42 
 
 
859 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  35.5 
 
 
675 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  30.92 
 
 
575 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  36.27 
 
 
685 aa  168  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  30.73 
 
 
2122 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  29.08 
 
 
2176 aa  164  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  31.29 
 
 
530 aa  162  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  29.19 
 
 
1620 aa  161  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  32.52 
 
 
1300 aa  157  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  38.37 
 
 
547 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  32.37 
 
 
996 aa  156  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  29.1 
 
 
1602 aa  154  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  27.52 
 
 
1292 aa  153  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  27.14 
 
 
838 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  31.98 
 
 
869 aa  151  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  35.49 
 
 
910 aa  150  8e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  34.23 
 
 
1042 aa  149  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  28.65 
 
 
1231 aa  147  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  32.21 
 
 
460 aa  146  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  33.13 
 
 
1120 aa  147  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  25.57 
 
 
952 aa  146  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  32.21 
 
 
1969 aa  145  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  37.55 
 
 
791 aa  140  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  36.84 
 
 
551 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  33.53 
 
 
1241 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  30 
 
 
861 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  26.3 
 
 
1814 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  36.67 
 
 
581 aa  137  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  36.92 
 
 
930 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  36.4 
 
 
3295 aa  135  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  34.02 
 
 
1732 aa  134  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  37.12 
 
 
719 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  36.26 
 
 
615 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  35.71 
 
 
786 aa  129  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  33.47 
 
 
845 aa  127  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  30.95 
 
 
971 aa  125  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  34.01 
 
 
870 aa  125  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  27.64 
 
 
1092 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  29.27 
 
 
823 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  34.92 
 
 
777 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  33.58 
 
 
840 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  30.98 
 
 
443 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  32.06 
 
 
2552 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1948  hypothetical protein  36.59 
 
 
616 aa  115  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  28.24 
 
 
1531 aa  114  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  31.38 
 
 
802 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  33.19 
 
 
819 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1019  hypothetical protein  34.52 
 
 
218 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.298297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2053  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
777 aa  105  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.120624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  34.78 
 
 
500 aa  105  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  41.26 
 
 
816 aa  105  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3047  hypothetical protein  34.18 
 
 
325 aa  104  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  38.22 
 
 
560 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  36.16 
 
 
1095 aa  103  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  31.93 
 
 
778 aa  102  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  24.84 
 
 
734 aa  101  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  30.21 
 
 
1230 aa  99.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  24.43 
 
 
1371 aa  99  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1944  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.34 
 
 
638 aa  99  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  36.36 
 
 
644 aa  98.2  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  29.1 
 
 
1987 aa  97.4  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  36.71 
 
 
519 aa  97.4  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  30.7 
 
 
929 aa  95.9  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  39.46 
 
 
769 aa  94  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  37.66 
 
 
184 aa  93.6  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  29.46 
 
 
1189 aa  93.2  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>