More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1472 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  60.42 
 
 		 713 aa  782    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  61.98 
 
 		 685 aa  771    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  100 
 
 		 658 aa  1328    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  57.89 
 
 		 679 aa  739    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  84.17 
 
 		 581 aa  959    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  66.23 
 
 		 675 aa  827    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  63.08 
 
 		 669 aa  767    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  74.64 
 
 		 735 aa  484  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  50.99 
 
 		 560 aa  474  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  71.85 
 
 		 1094 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  69.82 
 
 		 1682 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  72.09 
 
 		 752 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  69.23 
 
 		 2272 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  66.57 
 
 		 859 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  67.48 
 
 		 561 aa  420  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  62.35 
 
 		 1882 aa  395  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  62.65 
 
 		 1300 aa  393  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  63.25 
 
 		 2036 aa  395  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  62.05 
 
 		 1842 aa  387  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  70.25 
 
 		 791 aa  385  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  61.98 
 
 		 1120 aa  382  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  78.86 
 
 		 551 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  38.82 
 
 		 971 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  75.2 
 
 		 1969 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  60.48 
 
 		 2000 aa  373  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  61.05 
 
 		 1241 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  59.88 
 
 		 2122 aa  371  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  60.48 
 
 		 978 aa  371  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  74.31 
 
 		 575 aa  368  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  56.85 
 
 		 1667 aa  365  1e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  72.65 
 
 		 547 aa  356  6.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  54.74 
 
 		 1361 aa  342  9e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  54.22 
 
 		 1356 aa  332  2e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  51.58 
 
 		 963 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  52.4 
 
 		 528 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  48.84 
 
 		 1862 aa  318  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  62.72 
 
 		 615 aa  317  5e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  48.63 
 
 		 1282 aa  313  5.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  52.28 
 
 		 930 aa  313  9e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  37.12 
 
 		 938 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 		 2554 aa  295  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  47.45 
 
 		 530 aa  288  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  48.06 
 
 		 460 aa  278  3e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  47.89 
 
 		 838 aa  276  7e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  49.19 
 
 		 910 aa  275  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  55.68 
 
 		 3295 aa  273  7e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  45.11 
 
 		 941 aa  271  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  55.08 
 
 		 1732 aa  270  8e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  41.06 
 
 		 1001 aa  261  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  73.22 
 
 		 184 aa  259  9e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  42.81 
 
 		 958 aa  256  8e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  46.87 
 
 		 1667 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  52.19 
 
 		 1236 aa  251  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  46.55 
 
 		 861 aa  249  9e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  38.52 
 
 		 1528 aa  246  9e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  38.11 
 
 		 819 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  44.92 
 
 		 869 aa  244  3e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  44.44 
 
 		 1783 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  32.45 
 
 		 769 aa  234  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  69.36 
 
 		 644 aa  234  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  44.51 
 
 		 1387 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  45.08 
 
 		 728 aa  229  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40.12 
 
 		 823 aa  224  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  40.95 
 
 		 1292 aa  220  6e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  40.95 
 
 		 840 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  42.57 
 
 		 443 aa  212  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  33.52 
 
 		 771 aa  211  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  41.3 
 
 		 719 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  46.69 
 
 		 930 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  38.94 
 
 		 870 aa  204  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  47.35 
 
 		 2552 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  38.87 
 
 		 802 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  41.18 
 
 		 1011 aa  196  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  37.05 
 
 		 952 aa  195  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  43.8 
 
 		 786 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  37.72 
 
 		 845 aa  191  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  40.24 
 
 		 2176 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  39.18 
 
 		 960 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  44.72 
 
 		 777 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  42.39 
 
 		 819 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  36.16 
 
 		 1531 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  36.21 
 
 		 865 aa  177  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  34.88 
 
 		 1814 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  36.18 
 
 		 929 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  43.46 
 
 		 1095 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  48.98 
 
 		 519 aa  173  9e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  41.37 
 
 		 1189 aa  171  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  40.38 
 
 		 821 aa  169  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  38.08 
 
 		 379 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  35.65 
 
 		 1380 aa  170  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  34.74 
 
 		 439 aa  168  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  56.47 
 
 		 1231 aa  168  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  50.31 
 
 		 500 aa  165  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  51.11 
 
 		 1328 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  50.91 
 
 		 816 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  48.48 
 
 		 1931 aa  153  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  48.4 
 
 		 374 aa  152  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  49.72 
 
 		 996 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  43.15 
 
 		 408 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  41.91 
 
 		 1620 aa  147  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>