More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3736 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  78.2 
 
 		 2272 aa  798    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  77.21 
 
 		 1842 aa  770    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  79.06 
 
 		 1882 aa  652    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  86.78 
 
 		 2122 aa  723    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  85.22 
 
 		 2000 aa  728    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  100 
 
 		 978 aa  1965    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  74.41 
 
 		 1682 aa  1396    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  85.27 
 
 		 575 aa  715    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  77.43 
 
 		 2036 aa  624  1e-177  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  87.05 
 
 		 1969 aa  581  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  84.98 
 
 		 1120 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  83.73 
 
 		 1300 aa  550  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  82.73 
 
 		 1241 aa  551  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  58.46 
 
 		 561 aa  531  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  54.09 
 
 		 1094 aa  493  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  51.82 
 
 		 1667 aa  477  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  61.19 
 
 		 752 aa  474  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  49.43 
 
 		 1361 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  49.03 
 
 		 1862 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  46.1 
 
 		 1282 aa  431  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  48.02 
 
 		 963 aa  419  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  55.71 
 
 		 1356 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  53.46 
 
 		 735 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  84.84 
 
 		 547 aa  416  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  62.69 
 
 		 685 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  55.42 
 
 		 679 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  61.58 
 
 		 669 aa  392  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  61.31 
 
 		 713 aa  387  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  57.07 
 
 		 675 aa  389  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  52.59 
 
 		 2554 aa  385  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  61.14 
 
 		 859 aa  386  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  45.07 
 
 		 1236 aa  382  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  74.3 
 
 		 791 aa  375  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  49.43 
 
 		 528 aa  371  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  72.33 
 
 		 581 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  44.36 
 
 		 941 aa  368  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  36.44 
 
 		 838 aa  366  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  43.82 
 
 		 930 aa  365  3e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  74.49 
 
 		 551 aa  361  3e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  60.48 
 
 		 658 aa  360  8e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  45.23 
 
 		 530 aa  353  7e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  45.29 
 
 		 1667 aa  333  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  41.41 
 
 		 1528 aa  330  6e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  44.49 
 
 		 958 aa  323  9.999999999999999e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  63.82 
 
 		 615 aa  310  9e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  47.01 
 
 		 1732 aa  310  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  42.97 
 
 		 1387 aa  308  3e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  49.85 
 
 		 460 aa  296  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  80.23 
 
 		 184 aa  277  6e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  38.04 
 
 		 1011 aa  272  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  55.31 
 
 		 3295 aa  271  4e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  50.29 
 
 		 861 aa  271  5.9999999999999995e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  50.49 
 
 		 910 aa  265  4.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  38.91 
 
 		 1783 aa  259  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  35.97 
 
 		 2176 aa  243  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  35.8 
 
 		 952 aa  241  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  68.97 
 
 		 560 aa  239  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  42.77 
 
 		 869 aa  228  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  45.45 
 
 		 971 aa  228  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  35.17 
 
 		 1814 aa  228  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  40.71 
 
 		 1292 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  32.65 
 
 		 865 aa  222  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  67.08 
 
 		 644 aa  222  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  48.19 
 
 		 938 aa  204  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  39.94 
 
 		 840 aa  202  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  45.7 
 
 		 930 aa  201  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  45.42 
 
 		 823 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  39.73 
 
 		 719 aa  197  9e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  40.97 
 
 		 443 aa  196  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  39.02 
 
 		 802 aa  196  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  43.21 
 
 		 786 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  37.94 
 
 		 870 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  39.88 
 
 		 2552 aa  191  7e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  43.8 
 
 		 845 aa  190  9e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  44.58 
 
 		 819 aa  189  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  43.8 
 
 		 777 aa  188  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  32.67 
 
 		 1606 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  39.12 
 
 		 1095 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  37.67 
 
 		 929 aa  184  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  31.9 
 
 		 734 aa  184  9.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  58.29 
 
 		 1328 aa  180  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  33.08 
 
 		 1531 aa  177  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  44.12 
 
 		 960 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  32.32 
 
 		 1987 aa  174  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  32.12 
 
 		 1602 aa  171  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  48.17 
 
 		 519 aa  171  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  31.12 
 
 		 1620 aa  171  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  34.88 
 
 		 1380 aa  170  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  35.06 
 
 		 439 aa  170  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  40.48 
 
 		 1189 aa  170  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  43.45 
 
 		 940 aa  168  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  37.64 
 
 		 821 aa  162  3e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  45.71 
 
 		 1931 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1001 aa  157  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  53.94 
 
 		 819 aa  157  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  41.92 
 
 		 408 aa  156  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  42.16 
 
 		 848 aa  154  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  42.57 
 
 		 500 aa  153  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  39.19 
 
 		 1231 aa  151  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  48.59 
 
 		 816 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>